Protein–RNA interactions for Protein: Q7TS55

Tnfsf18, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 18, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf18Q7TS55 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Tnfsf18Q7TS55 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Tnfsf18Q7TS55 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Tnfsf18Q7TS55 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Tnfsf18Q7TS55 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Tnfsf18Q7TS55 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Tnfsf18Q7TS55 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Tnfsf18Q7TS55 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Tnfsf18Q7TS55 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Tnfsf18Q7TS55 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Tnfsf18Q7TS55 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Tnfsf18Q7TS55 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Tnfsf18Q7TS55 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Tnfsf18Q7TS55 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Tnfsf18Q7TS55 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Tnfsf18Q7TS55 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Tnfsf18Q7TS55 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Tnfsf18Q7TS55 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Tnfsf18Q7TS55 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Tnfsf18Q7TS55 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Tnfsf18Q7TS55 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Tnfsf18Q7TS55 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Tnfsf18Q7TS55 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Tnfsf18Q7TS55 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Tnfsf18Q7TS55 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Tnfsf18Q7TS55 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Tnfsf18Q7TS55 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Tnfsf18Q7TS55 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Tnfsf18Q7TS55 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Tnfsf18Q7TS55 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Tnfsf18Q7TS55 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Tnfsf18Q7TS55 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Tnfsf18Q7TS55 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Tnfsf18Q7TS55 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Tnfsf18Q7TS55 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Tnfsf18Q7TS55 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Tnfsf18Q7TS55 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Tnfsf18Q7TS55 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Tnfsf18Q7TS55 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Tnfsf18Q7TS55 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Tnfsf18Q7TS55 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Tnfsf18Q7TS55 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Tnfsf18Q7TS55 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Tnfsf18Q7TS55 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Tnfsf18Q7TS55 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Tnfsf18Q7TS55 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Tnfsf18Q7TS55 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Tnfsf18Q7TS55 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Tnfsf18Q7TS55 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Tnfsf18Q7TS55 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Tnfsf18Q7TS55 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Tnfsf18Q7TS55 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Tnfsf18Q7TS55 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Tnfsf18Q7TS55 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Tnfsf18Q7TS55 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Tnfsf18Q7TS55 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Tnfsf18Q7TS55 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Tnfsf18Q7TS55 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
Tnfsf18Q7TS55 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Tnfsf18Q7TS55 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Tnfsf18Q7TS55 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Tnfsf18Q7TS55 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Tnfsf18Q7TS55 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Tnfsf18Q7TS55 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Tnfsf18Q7TS55 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Tnfsf18Q7TS55 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Tnfsf18Q7TS55 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Tnfsf18Q7TS55 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Tnfsf18Q7TS55 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tnfsf18Q7TS55 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tnfsf18Q7TS55 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Tnfsf18Q7TS55 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tnfsf18Q7TS55 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tnfsf18Q7TS55 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tnfsf18Q7TS55 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tnfsf18Q7TS55 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tnfsf18Q7TS55 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tnfsf18Q7TS55 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tnfsf18Q7TS55 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tnfsf18Q7TS55 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Tnfsf18Q7TS55 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tnfsf18Q7TS55 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tnfsf18Q7TS55 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Tnfsf18Q7TS55 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tnfsf18Q7TS55 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tnfsf18Q7TS55 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tnfsf18Q7TS55 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tnfsf18Q7TS55 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tnfsf18Q7TS55 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tnfsf18Q7TS55 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tnfsf18Q7TS55 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tnfsf18Q7TS55 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tnfsf18Q7TS55 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tnfsf18Q7TS55 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tnfsf18Q7TS55 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tnfsf18Q7TS55 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tnfsf18Q7TS55 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tnfsf18Q7TS55 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tnfsf18Q7TS55 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tnfsf18Q7TS55 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms