Protein–RNA interactions for Protein: Q7TN16

Hhip, Hedgehog-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 700 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HhipQ7TN16 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
HhipQ7TN16 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HhipQ7TN16 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HhipQ7TN16 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HhipQ7TN16 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HhipQ7TN16 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HhipQ7TN16 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HhipQ7TN16 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HhipQ7TN16 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HhipQ7TN16 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HhipQ7TN16 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
HhipQ7TN16 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
HhipQ7TN16 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HhipQ7TN16 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
HhipQ7TN16 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HhipQ7TN16 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HhipQ7TN16 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
HhipQ7TN16 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HhipQ7TN16 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HhipQ7TN16 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HhipQ7TN16 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
HhipQ7TN16 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HhipQ7TN16 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HhipQ7TN16 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HhipQ7TN16 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HhipQ7TN16 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
HhipQ7TN16 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
HhipQ7TN16 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HhipQ7TN16 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HhipQ7TN16 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HhipQ7TN16 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HhipQ7TN16 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HhipQ7TN16 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HhipQ7TN16 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
HhipQ7TN16 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HhipQ7TN16 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HhipQ7TN16 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HhipQ7TN16 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HhipQ7TN16 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HhipQ7TN16 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HhipQ7TN16 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HhipQ7TN16 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HhipQ7TN16 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HhipQ7TN16 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HhipQ7TN16 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HhipQ7TN16 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HhipQ7TN16 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HhipQ7TN16 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HhipQ7TN16 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HhipQ7TN16 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HhipQ7TN16 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HhipQ7TN16 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HhipQ7TN16 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HhipQ7TN16 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HhipQ7TN16 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HhipQ7TN16 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HhipQ7TN16 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HhipQ7TN16 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HhipQ7TN16 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HhipQ7TN16 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HhipQ7TN16 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HhipQ7TN16 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
HhipQ7TN16 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HhipQ7TN16 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HhipQ7TN16 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HhipQ7TN16 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
HhipQ7TN16 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HhipQ7TN16 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HhipQ7TN16 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HhipQ7TN16 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HhipQ7TN16 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HhipQ7TN16 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HhipQ7TN16 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HhipQ7TN16 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HhipQ7TN16 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HhipQ7TN16 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HhipQ7TN16 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HhipQ7TN16 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HhipQ7TN16 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HhipQ7TN16 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HhipQ7TN16 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HhipQ7TN16 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HhipQ7TN16 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HhipQ7TN16 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HhipQ7TN16 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HhipQ7TN16 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HhipQ7TN16 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HhipQ7TN16 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HhipQ7TN16 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HhipQ7TN16 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HhipQ7TN16 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HhipQ7TN16 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HhipQ7TN16 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HhipQ7TN16 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HhipQ7TN16 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HhipQ7TN16 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HhipQ7TN16 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HhipQ7TN16 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HhipQ7TN16 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HhipQ7TN16 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms