Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMB3

Ppp1r3c, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 3C, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp1r3cQ7TMB3 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ppp1r3cQ7TMB3 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ppp1r3cQ7TMB3 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ppp1r3cQ7TMB3 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ppp1r3cQ7TMB3 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ppp1r3cQ7TMB3 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ppp1r3cQ7TMB3 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ppp1r3cQ7TMB3 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ppp1r3cQ7TMB3 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ppp1r3cQ7TMB3 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ppp1r3cQ7TMB3 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ppp1r3cQ7TMB3 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ppp1r3cQ7TMB3 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ppp1r3cQ7TMB3 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ppp1r3cQ7TMB3 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ppp1r3cQ7TMB3 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ppp1r3cQ7TMB3 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ppp1r3cQ7TMB3 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ppp1r3cQ7TMB3 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ppp1r3cQ7TMB3 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ppp1r3cQ7TMB3 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ppp1r3cQ7TMB3 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ppp1r3cQ7TMB3 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ppp1r3cQ7TMB3 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ppp1r3cQ7TMB3 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ppp1r3cQ7TMB3 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ppp1r3cQ7TMB3 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ppp1r3cQ7TMB3 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ppp1r3cQ7TMB3 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ppp1r3cQ7TMB3 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ppp1r3cQ7TMB3 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ppp1r3cQ7TMB3 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ppp1r3cQ7TMB3 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ppp1r3cQ7TMB3 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ppp1r3cQ7TMB3 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ppp1r3cQ7TMB3 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ppp1r3cQ7TMB3 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ppp1r3cQ7TMB3 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ppp1r3cQ7TMB3 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ppp1r3cQ7TMB3 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ppp1r3cQ7TMB3 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ppp1r3cQ7TMB3 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ppp1r3cQ7TMB3 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ppp1r3cQ7TMB3 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ppp1r3cQ7TMB3 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ppp1r3cQ7TMB3 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ppp1r3cQ7TMB3 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ppp1r3cQ7TMB3 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ppp1r3cQ7TMB3 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ppp1r3cQ7TMB3 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ppp1r3cQ7TMB3 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ppp1r3cQ7TMB3 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ppp1r3cQ7TMB3 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ppp1r3cQ7TMB3 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ppp1r3cQ7TMB3 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ppp1r3cQ7TMB3 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ppp1r3cQ7TMB3 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ppp1r3cQ7TMB3 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ppp1r3cQ7TMB3 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ppp1r3cQ7TMB3 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ppp1r3cQ7TMB3 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ppp1r3cQ7TMB3 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ppp1r3cQ7TMB3 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ppp1r3cQ7TMB3 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ppp1r3cQ7TMB3 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ppp1r3cQ7TMB3 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ppp1r3cQ7TMB3 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ppp1r3cQ7TMB3 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ppp1r3cQ7TMB3 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ppp1r3cQ7TMB3 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ppp1r3cQ7TMB3 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ppp1r3cQ7TMB3 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ppp1r3cQ7TMB3 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ppp1r3cQ7TMB3 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ppp1r3cQ7TMB3 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ppp1r3cQ7TMB3 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ppp1r3cQ7TMB3 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ppp1r3cQ7TMB3 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ppp1r3cQ7TMB3 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ppp1r3cQ7TMB3 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ppp1r3cQ7TMB3 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ppp1r3cQ7TMB3 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ppp1r3cQ7TMB3 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ppp1r3cQ7TMB3 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ppp1r3cQ7TMB3 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ppp1r3cQ7TMB3 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ppp1r3cQ7TMB3 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ppp1r3cQ7TMB3 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ppp1r3cQ7TMB3 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ppp1r3cQ7TMB3 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ppp1r3cQ7TMB3 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ppp1r3cQ7TMB3 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ppp1r3cQ7TMB3 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ppp1r3cQ7TMB3 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ppp1r3cQ7TMB3 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ppp1r3cQ7TMB3 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ppp1r3cQ7TMB3 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ppp1r3cQ7TMB3 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ppp1r3cQ7TMB3 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ppp1r3cQ7TMB3 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms