Protein–RNA interactions for Protein: Q7M764

Usp17le, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein E, mousemouse

Predictions only

Length 540 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp17leQ7M764 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Usp17leQ7M764 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Usp17leQ7M764 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Usp17leQ7M764 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Usp17leQ7M764 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Usp17leQ7M764 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Usp17leQ7M764 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Usp17leQ7M764 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Usp17leQ7M764 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Usp17leQ7M764 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Usp17leQ7M764 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Usp17leQ7M764 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Usp17leQ7M764 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Usp17leQ7M764 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Usp17leQ7M764 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Usp17leQ7M764 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Usp17leQ7M764 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Usp17leQ7M764 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Usp17leQ7M764 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Usp17leQ7M764 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Usp17leQ7M764 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Usp17leQ7M764 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Usp17leQ7M764 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Usp17leQ7M764 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Usp17leQ7M764 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Usp17leQ7M764 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Usp17leQ7M764 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Usp17leQ7M764 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Usp17leQ7M764 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Usp17leQ7M764 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Usp17leQ7M764 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Usp17leQ7M764 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Usp17leQ7M764 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Usp17leQ7M764 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Usp17leQ7M764 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Usp17leQ7M764 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Usp17leQ7M764 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Usp17leQ7M764 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Usp17leQ7M764 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Usp17leQ7M764 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Usp17leQ7M764 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Usp17leQ7M764 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Usp17leQ7M764 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Usp17leQ7M764 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Usp17leQ7M764 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Usp17leQ7M764 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Usp17leQ7M764 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Usp17leQ7M764 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Usp17leQ7M764 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Usp17leQ7M764 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Usp17leQ7M764 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Usp17leQ7M764 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Usp17leQ7M764 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Usp17leQ7M764 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Usp17leQ7M764 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Usp17leQ7M764 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Usp17leQ7M764 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Usp17leQ7M764 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Usp17leQ7M764 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Usp17leQ7M764 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Usp17leQ7M764 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Usp17leQ7M764 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Usp17leQ7M764 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Usp17leQ7M764 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Usp17leQ7M764 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Usp17leQ7M764 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Usp17leQ7M764 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Usp17leQ7M764 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Usp17leQ7M764 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Usp17leQ7M764 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Usp17leQ7M764 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Usp17leQ7M764 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Usp17leQ7M764 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Usp17leQ7M764 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Usp17leQ7M764 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Usp17leQ7M764 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Usp17leQ7M764 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Usp17leQ7M764 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Usp17leQ7M764 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Usp17leQ7M764 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Usp17leQ7M764 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Usp17leQ7M764 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Usp17leQ7M764 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Usp17leQ7M764 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Usp17leQ7M764 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Usp17leQ7M764 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Usp17leQ7M764 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Usp17leQ7M764 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Usp17leQ7M764 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Usp17leQ7M764 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Usp17leQ7M764 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Usp17leQ7M764 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Usp17leQ7M764 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Usp17leQ7M764 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Usp17leQ7M764 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Usp17leQ7M764 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Usp17leQ7M764 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Usp17leQ7M764 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Usp17leQ7M764 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Usp17leQ7M764 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms