Protein–RNA interactions for Protein: Q78YZ6

Scoc, Short coiled-coil protein, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScocQ78YZ6 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ScocQ78YZ6 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ScocQ78YZ6 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ScocQ78YZ6 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ScocQ78YZ6 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ScocQ78YZ6 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ScocQ78YZ6 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ScocQ78YZ6 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ScocQ78YZ6 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ScocQ78YZ6 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ScocQ78YZ6 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ScocQ78YZ6 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ScocQ78YZ6 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ScocQ78YZ6 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ScocQ78YZ6 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ScocQ78YZ6 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ScocQ78YZ6 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ScocQ78YZ6 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ScocQ78YZ6 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ScocQ78YZ6 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ScocQ78YZ6 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
ScocQ78YZ6 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ScocQ78YZ6 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ScocQ78YZ6 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ScocQ78YZ6 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ScocQ78YZ6 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ScocQ78YZ6 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ScocQ78YZ6 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ScocQ78YZ6 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ScocQ78YZ6 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ScocQ78YZ6 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ScocQ78YZ6 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ScocQ78YZ6 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ScocQ78YZ6 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ScocQ78YZ6 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ScocQ78YZ6 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ScocQ78YZ6 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ScocQ78YZ6 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ScocQ78YZ6 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ScocQ78YZ6 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ScocQ78YZ6 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ScocQ78YZ6 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ScocQ78YZ6 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ScocQ78YZ6 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
ScocQ78YZ6 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ScocQ78YZ6 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ScocQ78YZ6 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ScocQ78YZ6 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ScocQ78YZ6 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
ScocQ78YZ6 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ScocQ78YZ6 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ScocQ78YZ6 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ScocQ78YZ6 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ScocQ78YZ6 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ScocQ78YZ6 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ScocQ78YZ6 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ScocQ78YZ6 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ScocQ78YZ6 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ScocQ78YZ6 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
ScocQ78YZ6 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ScocQ78YZ6 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ScocQ78YZ6 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ScocQ78YZ6 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ScocQ78YZ6 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ScocQ78YZ6 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ScocQ78YZ6 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ScocQ78YZ6 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ScocQ78YZ6 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ScocQ78YZ6 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ScocQ78YZ6 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
ScocQ78YZ6 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ScocQ78YZ6 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ScocQ78YZ6 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ScocQ78YZ6 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ScocQ78YZ6 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ScocQ78YZ6 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ScocQ78YZ6 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ScocQ78YZ6 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ScocQ78YZ6 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ScocQ78YZ6 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ScocQ78YZ6 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ScocQ78YZ6 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ScocQ78YZ6 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
ScocQ78YZ6 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ScocQ78YZ6 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ScocQ78YZ6 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ScocQ78YZ6 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ScocQ78YZ6 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ScocQ78YZ6 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ScocQ78YZ6 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ScocQ78YZ6 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ScocQ78YZ6 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ScocQ78YZ6 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ScocQ78YZ6 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ScocQ78YZ6 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ScocQ78YZ6 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ScocQ78YZ6 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ScocQ78YZ6 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ScocQ78YZ6 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ScocQ78YZ6 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
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