Protein–RNA interactions for Protein: Q715T0

Nme8, Thioredoxin domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme8Q715T0 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nme8Q715T0 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nme8Q715T0 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nme8Q715T0 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Nme8Q715T0 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nme8Q715T0 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nme8Q715T0 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nme8Q715T0 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Nme8Q715T0 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nme8Q715T0 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nme8Q715T0 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nme8Q715T0 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Nme8Q715T0 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nme8Q715T0 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nme8Q715T0 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nme8Q715T0 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nme8Q715T0 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nme8Q715T0 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nme8Q715T0 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nme8Q715T0 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nme8Q715T0 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nme8Q715T0 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nme8Q715T0 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nme8Q715T0 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nme8Q715T0 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nme8Q715T0 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nme8Q715T0 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Nme8Q715T0 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nme8Q715T0 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nme8Q715T0 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nme8Q715T0 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nme8Q715T0 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nme8Q715T0 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nme8Q715T0 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Nme8Q715T0 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nme8Q715T0 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Nme8Q715T0 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Nme8Q715T0 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nme8Q715T0 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nme8Q715T0 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nme8Q715T0 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nme8Q715T0 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nme8Q715T0 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nme8Q715T0 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nme8Q715T0 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nme8Q715T0 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nme8Q715T0 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nme8Q715T0 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nme8Q715T0 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nme8Q715T0 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nme8Q715T0 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nme8Q715T0 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nme8Q715T0 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nme8Q715T0 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nme8Q715T0 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nme8Q715T0 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nme8Q715T0 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nme8Q715T0 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nme8Q715T0 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Nme8Q715T0 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Nme8Q715T0 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nme8Q715T0 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nme8Q715T0 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Nme8Q715T0 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nme8Q715T0 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nme8Q715T0 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nme8Q715T0 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nme8Q715T0 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nme8Q715T0 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nme8Q715T0 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nme8Q715T0 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nme8Q715T0 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nme8Q715T0 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nme8Q715T0 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Nme8Q715T0 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nme8Q715T0 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Nme8Q715T0 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nme8Q715T0 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nme8Q715T0 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nme8Q715T0 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Nme8Q715T0 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nme8Q715T0 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Nme8Q715T0 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nme8Q715T0 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nme8Q715T0 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nme8Q715T0 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nme8Q715T0 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Nme8Q715T0 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nme8Q715T0 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nme8Q715T0 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nme8Q715T0 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nme8Q715T0 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nme8Q715T0 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nme8Q715T0 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nme8Q715T0 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nme8Q715T0 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nme8Q715T0 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nme8Q715T0 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nme8Q715T0 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nme8Q715T0 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms