Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWZ2

Ube2r2, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 R2, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2r2Q6ZWZ2 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ube2r2Q6ZWZ2 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ube2r2Q6ZWZ2 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ube2r2Q6ZWZ2 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ube2r2Q6ZWZ2 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ube2r2Q6ZWZ2 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ube2r2Q6ZWZ2 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ube2r2Q6ZWZ2 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Ube2r2Q6ZWZ2 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ube2r2Q6ZWZ2 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ube2r2Q6ZWZ2 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ube2r2Q6ZWZ2 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ube2r2Q6ZWZ2 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ube2r2Q6ZWZ2 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ube2r2Q6ZWZ2 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ube2r2Q6ZWZ2 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ube2r2Q6ZWZ2 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ube2r2Q6ZWZ2 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ube2r2Q6ZWZ2 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ube2r2Q6ZWZ2 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Ube2r2Q6ZWZ2 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ube2r2Q6ZWZ2 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ube2r2Q6ZWZ2 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ube2r2Q6ZWZ2 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ube2r2Q6ZWZ2 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ube2r2Q6ZWZ2 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ube2r2Q6ZWZ2 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ube2r2Q6ZWZ2 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ube2r2Q6ZWZ2 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ube2r2Q6ZWZ2 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ube2r2Q6ZWZ2 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ube2r2Q6ZWZ2 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ube2r2Q6ZWZ2 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ube2r2Q6ZWZ2 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ube2r2Q6ZWZ2 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ube2r2Q6ZWZ2 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ube2r2Q6ZWZ2 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ube2r2Q6ZWZ2 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ube2r2Q6ZWZ2 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ube2r2Q6ZWZ2 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ube2r2Q6ZWZ2 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Ube2r2Q6ZWZ2 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ube2r2Q6ZWZ2 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ube2r2Q6ZWZ2 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ube2r2Q6ZWZ2 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ube2r2Q6ZWZ2 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ube2r2Q6ZWZ2 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ube2r2Q6ZWZ2 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ube2r2Q6ZWZ2 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Ube2r2Q6ZWZ2 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ube2r2Q6ZWZ2 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ube2r2Q6ZWZ2 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Ube2r2Q6ZWZ2 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ube2r2Q6ZWZ2 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Ube2r2Q6ZWZ2 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ube2r2Q6ZWZ2 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ube2r2Q6ZWZ2 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ube2r2Q6ZWZ2 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ube2r2Q6ZWZ2 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ube2r2Q6ZWZ2 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ube2r2Q6ZWZ2 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ube2r2Q6ZWZ2 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Ube2r2Q6ZWZ2 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ube2r2Q6ZWZ2 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ube2r2Q6ZWZ2 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ube2r2Q6ZWZ2 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ube2r2Q6ZWZ2 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ube2r2Q6ZWZ2 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ube2r2Q6ZWZ2 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ube2r2Q6ZWZ2 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ube2r2Q6ZWZ2 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ube2r2Q6ZWZ2 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ube2r2Q6ZWZ2 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ube2r2Q6ZWZ2 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ube2r2Q6ZWZ2 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ube2r2Q6ZWZ2 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ube2r2Q6ZWZ2 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ube2r2Q6ZWZ2 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ube2r2Q6ZWZ2 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ube2r2Q6ZWZ2 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ube2r2Q6ZWZ2 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ube2r2Q6ZWZ2 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ube2r2Q6ZWZ2 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Ube2r2Q6ZWZ2 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ube2r2Q6ZWZ2 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ube2r2Q6ZWZ2 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ube2r2Q6ZWZ2 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ube2r2Q6ZWZ2 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ube2r2Q6ZWZ2 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ube2r2Q6ZWZ2 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms