Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQL4

Wdr43, WD repeat-containing protein 43, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr43Q6ZQL4 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Wdr43Q6ZQL4 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Wdr43Q6ZQL4 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Wdr43Q6ZQL4 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Wdr43Q6ZQL4 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Wdr43Q6ZQL4 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Wdr43Q6ZQL4 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Wdr43Q6ZQL4 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Wdr43Q6ZQL4 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Wdr43Q6ZQL4 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Wdr43Q6ZQL4 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Wdr43Q6ZQL4 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Wdr43Q6ZQL4 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Wdr43Q6ZQL4 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Wdr43Q6ZQL4 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Wdr43Q6ZQL4 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Wdr43Q6ZQL4 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Wdr43Q6ZQL4 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Wdr43Q6ZQL4 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Wdr43Q6ZQL4 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Wdr43Q6ZQL4 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Wdr43Q6ZQL4 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Wdr43Q6ZQL4 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Wdr43Q6ZQL4 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Wdr43Q6ZQL4 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Wdr43Q6ZQL4 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Wdr43Q6ZQL4 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Wdr43Q6ZQL4 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Wdr43Q6ZQL4 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Wdr43Q6ZQL4 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Wdr43Q6ZQL4 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Wdr43Q6ZQL4 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Wdr43Q6ZQL4 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Wdr43Q6ZQL4 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Wdr43Q6ZQL4 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Wdr43Q6ZQL4 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Wdr43Q6ZQL4 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Wdr43Q6ZQL4 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Wdr43Q6ZQL4 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Wdr43Q6ZQL4 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Wdr43Q6ZQL4 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Wdr43Q6ZQL4 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Wdr43Q6ZQL4 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Wdr43Q6ZQL4 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Wdr43Q6ZQL4 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Wdr43Q6ZQL4 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Wdr43Q6ZQL4 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Wdr43Q6ZQL4 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Wdr43Q6ZQL4 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Wdr43Q6ZQL4 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Wdr43Q6ZQL4 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Wdr43Q6ZQL4 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Wdr43Q6ZQL4 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Wdr43Q6ZQL4 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Wdr43Q6ZQL4 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Wdr43Q6ZQL4 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Wdr43Q6ZQL4 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Wdr43Q6ZQL4 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Wdr43Q6ZQL4 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Wdr43Q6ZQL4 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Wdr43Q6ZQL4 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Wdr43Q6ZQL4 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Wdr43Q6ZQL4 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Wdr43Q6ZQL4 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Wdr43Q6ZQL4 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Wdr43Q6ZQL4 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Wdr43Q6ZQL4 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Wdr43Q6ZQL4 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Wdr43Q6ZQL4 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Wdr43Q6ZQL4 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Wdr43Q6ZQL4 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Wdr43Q6ZQL4 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Wdr43Q6ZQL4 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Wdr43Q6ZQL4 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Wdr43Q6ZQL4 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Wdr43Q6ZQL4 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Wdr43Q6ZQL4 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Wdr43Q6ZQL4 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Wdr43Q6ZQL4 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Wdr43Q6ZQL4 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Wdr43Q6ZQL4 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Wdr43Q6ZQL4 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Wdr43Q6ZQL4 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Wdr43Q6ZQL4 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Wdr43Q6ZQL4 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Wdr43Q6ZQL4 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Wdr43Q6ZQL4 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Wdr43Q6ZQL4 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Wdr43Q6ZQL4 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Wdr43Q6ZQL4 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Wdr43Q6ZQL4 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Wdr43Q6ZQL4 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Wdr43Q6ZQL4 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Wdr43Q6ZQL4 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Wdr43Q6ZQL4 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Wdr43Q6ZQL4 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Wdr43Q6ZQL4 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Wdr43Q6ZQL4 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Wdr43Q6ZQL4 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Wdr43Q6ZQL4 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms