Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ18

Efr3b, Protein EFR3 homolog B, mousemouse

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Length 817 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efr3bQ6ZQ18 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Efr3bQ6ZQ18 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Efr3bQ6ZQ18 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Efr3bQ6ZQ18 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Efr3bQ6ZQ18 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Efr3bQ6ZQ18 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Efr3bQ6ZQ18 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Efr3bQ6ZQ18 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
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Efr3bQ6ZQ18 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Efr3bQ6ZQ18 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Efr3bQ6ZQ18 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Efr3bQ6ZQ18 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Efr3bQ6ZQ18 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Efr3bQ6ZQ18 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Efr3bQ6ZQ18 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Efr3bQ6ZQ18 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Efr3bQ6ZQ18 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Efr3bQ6ZQ18 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Efr3bQ6ZQ18 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Efr3bQ6ZQ18 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Efr3bQ6ZQ18 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Efr3bQ6ZQ18 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
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Efr3bQ6ZQ18 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
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Efr3bQ6ZQ18 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Efr3bQ6ZQ18 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Efr3bQ6ZQ18 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Efr3bQ6ZQ18 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Efr3bQ6ZQ18 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Efr3bQ6ZQ18 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
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Efr3bQ6ZQ18 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Efr3bQ6ZQ18 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Efr3bQ6ZQ18 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Efr3bQ6ZQ18 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Efr3bQ6ZQ18 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Efr3bQ6ZQ18 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
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Efr3bQ6ZQ18 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Efr3bQ6ZQ18 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
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Efr3bQ6ZQ18 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
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Efr3bQ6ZQ18 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
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Efr3bQ6ZQ18 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Efr3bQ6ZQ18 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Efr3bQ6ZQ18 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
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Efr3bQ6ZQ18 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Efr3bQ6ZQ18 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Efr3bQ6ZQ18 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Efr3bQ6ZQ18 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Efr3bQ6ZQ18 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Efr3bQ6ZQ18 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
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Efr3bQ6ZQ18 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Efr3bQ6ZQ18 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Efr3bQ6ZQ18 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Efr3bQ6ZQ18 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Efr3bQ6ZQ18 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Efr3bQ6ZQ18 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Efr3bQ6ZQ18 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Efr3bQ6ZQ18 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Efr3bQ6ZQ18 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Efr3bQ6ZQ18 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
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