Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ12

Ninl, Ninein-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,394 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NinlQ6ZQ12 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
NinlQ6ZQ12 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NinlQ6ZQ12 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NinlQ6ZQ12 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NinlQ6ZQ12 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
NinlQ6ZQ12 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NinlQ6ZQ12 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NinlQ6ZQ12 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NinlQ6ZQ12 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NinlQ6ZQ12 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NinlQ6ZQ12 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NinlQ6ZQ12 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NinlQ6ZQ12 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NinlQ6ZQ12 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NinlQ6ZQ12 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NinlQ6ZQ12 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NinlQ6ZQ12 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NinlQ6ZQ12 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NinlQ6ZQ12 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NinlQ6ZQ12 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NinlQ6ZQ12 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NinlQ6ZQ12 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NinlQ6ZQ12 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NinlQ6ZQ12 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NinlQ6ZQ12 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NinlQ6ZQ12 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NinlQ6ZQ12 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NinlQ6ZQ12 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NinlQ6ZQ12 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NinlQ6ZQ12 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NinlQ6ZQ12 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NinlQ6ZQ12 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NinlQ6ZQ12 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NinlQ6ZQ12 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NinlQ6ZQ12 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NinlQ6ZQ12 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NinlQ6ZQ12 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NinlQ6ZQ12 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
NinlQ6ZQ12 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NinlQ6ZQ12 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NinlQ6ZQ12 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NinlQ6ZQ12 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NinlQ6ZQ12 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NinlQ6ZQ12 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NinlQ6ZQ12 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NinlQ6ZQ12 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NinlQ6ZQ12 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NinlQ6ZQ12 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NinlQ6ZQ12 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NinlQ6ZQ12 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NinlQ6ZQ12 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NinlQ6ZQ12 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NinlQ6ZQ12 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NinlQ6ZQ12 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NinlQ6ZQ12 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
NinlQ6ZQ12 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
NinlQ6ZQ12 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NinlQ6ZQ12 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NinlQ6ZQ12 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NinlQ6ZQ12 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NinlQ6ZQ12 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NinlQ6ZQ12 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NinlQ6ZQ12 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NinlQ6ZQ12 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NinlQ6ZQ12 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NinlQ6ZQ12 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NinlQ6ZQ12 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NinlQ6ZQ12 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NinlQ6ZQ12 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NinlQ6ZQ12 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NinlQ6ZQ12 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NinlQ6ZQ12 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NinlQ6ZQ12 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NinlQ6ZQ12 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NinlQ6ZQ12 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NinlQ6ZQ12 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NinlQ6ZQ12 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NinlQ6ZQ12 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NinlQ6ZQ12 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NinlQ6ZQ12 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NinlQ6ZQ12 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NinlQ6ZQ12 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NinlQ6ZQ12 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NinlQ6ZQ12 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NinlQ6ZQ12 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NinlQ6ZQ12 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NinlQ6ZQ12 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NinlQ6ZQ12 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NinlQ6ZQ12 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NinlQ6ZQ12 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NinlQ6ZQ12 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NinlQ6ZQ12 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NinlQ6ZQ12 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NinlQ6ZQ12 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
NinlQ6ZQ12 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NinlQ6ZQ12 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NinlQ6ZQ12 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NinlQ6ZQ12 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NinlQ6ZQ12 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NinlQ6ZQ12 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
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