Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPI3

Lcor, Ligand-dependent corepressor, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LcorQ6ZPI3 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LcorQ6ZPI3 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LcorQ6ZPI3 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LcorQ6ZPI3 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LcorQ6ZPI3 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LcorQ6ZPI3 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
LcorQ6ZPI3 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LcorQ6ZPI3 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LcorQ6ZPI3 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LcorQ6ZPI3 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LcorQ6ZPI3 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LcorQ6ZPI3 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LcorQ6ZPI3 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LcorQ6ZPI3 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LcorQ6ZPI3 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
LcorQ6ZPI3 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LcorQ6ZPI3 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LcorQ6ZPI3 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LcorQ6ZPI3 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LcorQ6ZPI3 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LcorQ6ZPI3 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LcorQ6ZPI3 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
LcorQ6ZPI3 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LcorQ6ZPI3 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LcorQ6ZPI3 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LcorQ6ZPI3 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LcorQ6ZPI3 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
LcorQ6ZPI3 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LcorQ6ZPI3 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LcorQ6ZPI3 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
LcorQ6ZPI3 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LcorQ6ZPI3 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LcorQ6ZPI3 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LcorQ6ZPI3 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LcorQ6ZPI3 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LcorQ6ZPI3 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LcorQ6ZPI3 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LcorQ6ZPI3 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LcorQ6ZPI3 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LcorQ6ZPI3 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LcorQ6ZPI3 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LcorQ6ZPI3 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LcorQ6ZPI3 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LcorQ6ZPI3 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LcorQ6ZPI3 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LcorQ6ZPI3 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LcorQ6ZPI3 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LcorQ6ZPI3 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LcorQ6ZPI3 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LcorQ6ZPI3 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LcorQ6ZPI3 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LcorQ6ZPI3 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LcorQ6ZPI3 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LcorQ6ZPI3 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LcorQ6ZPI3 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
LcorQ6ZPI3 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LcorQ6ZPI3 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LcorQ6ZPI3 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LcorQ6ZPI3 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LcorQ6ZPI3 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LcorQ6ZPI3 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LcorQ6ZPI3 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LcorQ6ZPI3 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LcorQ6ZPI3 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LcorQ6ZPI3 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LcorQ6ZPI3 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LcorQ6ZPI3 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LcorQ6ZPI3 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LcorQ6ZPI3 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LcorQ6ZPI3 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LcorQ6ZPI3 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
LcorQ6ZPI3 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LcorQ6ZPI3 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LcorQ6ZPI3 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LcorQ6ZPI3 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LcorQ6ZPI3 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LcorQ6ZPI3 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LcorQ6ZPI3 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LcorQ6ZPI3 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LcorQ6ZPI3 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LcorQ6ZPI3 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LcorQ6ZPI3 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LcorQ6ZPI3 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LcorQ6ZPI3 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LcorQ6ZPI3 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LcorQ6ZPI3 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LcorQ6ZPI3 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LcorQ6ZPI3 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LcorQ6ZPI3 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LcorQ6ZPI3 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
LcorQ6ZPI3 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LcorQ6ZPI3 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LcorQ6ZPI3 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LcorQ6ZPI3 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LcorQ6ZPI3 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LcorQ6ZPI3 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LcorQ6ZPI3 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LcorQ6ZPI3 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LcorQ6ZPI3 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LcorQ6ZPI3 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms