Protein–RNA interactions for Protein: Q6X893

Slc44a1, Choline transporter-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc44a1Q6X893 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Slc44a1Q6X893 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Slc44a1Q6X893 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Slc44a1Q6X893 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Slc44a1Q6X893 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Slc44a1Q6X893 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Slc44a1Q6X893 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Slc44a1Q6X893 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Slc44a1Q6X893 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Slc44a1Q6X893 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Slc44a1Q6X893 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Slc44a1Q6X893 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Slc44a1Q6X893 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Slc44a1Q6X893 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Slc44a1Q6X893 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Slc44a1Q6X893 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Slc44a1Q6X893 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Slc44a1Q6X893 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Slc44a1Q6X893 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Slc44a1Q6X893 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Slc44a1Q6X893 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Slc44a1Q6X893 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Slc44a1Q6X893 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Slc44a1Q6X893 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Slc44a1Q6X893 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Slc44a1Q6X893 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Slc44a1Q6X893 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Slc44a1Q6X893 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Slc44a1Q6X893 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Slc44a1Q6X893 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Slc44a1Q6X893 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Slc44a1Q6X893 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Slc44a1Q6X893 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Slc44a1Q6X893 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Slc44a1Q6X893 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Slc44a1Q6X893 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Slc44a1Q6X893 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Slc44a1Q6X893 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Slc44a1Q6X893 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Slc44a1Q6X893 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Slc44a1Q6X893 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Slc44a1Q6X893 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Slc44a1Q6X893 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Slc44a1Q6X893 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Slc44a1Q6X893 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Slc44a1Q6X893 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Slc44a1Q6X893 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Slc44a1Q6X893 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Slc44a1Q6X893 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Slc44a1Q6X893 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Slc44a1Q6X893 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Slc44a1Q6X893 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Slc44a1Q6X893 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Slc44a1Q6X893 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Slc44a1Q6X893 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Slc44a1Q6X893 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Slc44a1Q6X893 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Slc44a1Q6X893 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Slc44a1Q6X893 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Slc44a1Q6X893 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Slc44a1Q6X893 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Slc44a1Q6X893 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Slc44a1Q6X893 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Slc44a1Q6X893 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Slc44a1Q6X893 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Slc44a1Q6X893 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Slc44a1Q6X893 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Slc44a1Q6X893 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Slc44a1Q6X893 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Slc44a1Q6X893 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Slc44a1Q6X893 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Slc44a1Q6X893 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Slc44a1Q6X893 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Slc44a1Q6X893 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Slc44a1Q6X893 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Slc44a1Q6X893 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Slc44a1Q6X893 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Slc44a1Q6X893 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Slc44a1Q6X893 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Slc44a1Q6X893 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Slc44a1Q6X893 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Slc44a1Q6X893 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Slc44a1Q6X893 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Slc44a1Q6X893 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Slc44a1Q6X893 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Slc44a1Q6X893 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Slc44a1Q6X893 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Slc44a1Q6X893 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Slc44a1Q6X893 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Slc44a1Q6X893 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Slc44a1Q6X893 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Slc44a1Q6X893 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Slc44a1Q6X893 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Slc44a1Q6X893 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Slc44a1Q6X893 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Slc44a1Q6X893 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Slc44a1Q6X893 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Slc44a1Q6X893 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Slc44a1Q6X893 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Slc44a1Q6X893 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms