Protein–RNA interactions for Protein: Q6W8Q3

Pcp4l1, Purkinje cell protein 4-like protein 1, mousemouse

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Length 68 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcp4l1Q6W8Q3 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pcp4l1Q6W8Q3 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pcp4l1Q6W8Q3 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pcp4l1Q6W8Q3 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pcp4l1Q6W8Q3 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pcp4l1Q6W8Q3 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pcp4l1Q6W8Q3 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pcp4l1Q6W8Q3 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pcp4l1Q6W8Q3 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pcp4l1Q6W8Q3 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pcp4l1Q6W8Q3 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pcp4l1Q6W8Q3 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pcp4l1Q6W8Q3 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pcp4l1Q6W8Q3 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pcp4l1Q6W8Q3 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pcp4l1Q6W8Q3 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pcp4l1Q6W8Q3 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pcp4l1Q6W8Q3 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pcp4l1Q6W8Q3 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pcp4l1Q6W8Q3 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pcp4l1Q6W8Q3 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pcp4l1Q6W8Q3 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pcp4l1Q6W8Q3 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pcp4l1Q6W8Q3 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pcp4l1Q6W8Q3 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pcp4l1Q6W8Q3 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pcp4l1Q6W8Q3 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pcp4l1Q6W8Q3 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pcp4l1Q6W8Q3 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Pcp4l1Q6W8Q3 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pcp4l1Q6W8Q3 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pcp4l1Q6W8Q3 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pcp4l1Q6W8Q3 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pcp4l1Q6W8Q3 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Pcp4l1Q6W8Q3 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pcp4l1Q6W8Q3 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pcp4l1Q6W8Q3 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pcp4l1Q6W8Q3 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pcp4l1Q6W8Q3 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pcp4l1Q6W8Q3 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pcp4l1Q6W8Q3 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pcp4l1Q6W8Q3 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pcp4l1Q6W8Q3 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pcp4l1Q6W8Q3 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pcp4l1Q6W8Q3 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pcp4l1Q6W8Q3 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pcp4l1Q6W8Q3 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pcp4l1Q6W8Q3 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pcp4l1Q6W8Q3 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pcp4l1Q6W8Q3 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pcp4l1Q6W8Q3 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pcp4l1Q6W8Q3 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pcp4l1Q6W8Q3 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pcp4l1Q6W8Q3 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pcp4l1Q6W8Q3 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pcp4l1Q6W8Q3 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pcp4l1Q6W8Q3 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pcp4l1Q6W8Q3 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pcp4l1Q6W8Q3 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pcp4l1Q6W8Q3 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pcp4l1Q6W8Q3 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pcp4l1Q6W8Q3 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pcp4l1Q6W8Q3 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pcp4l1Q6W8Q3 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pcp4l1Q6W8Q3 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pcp4l1Q6W8Q3 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pcp4l1Q6W8Q3 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pcp4l1Q6W8Q3 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pcp4l1Q6W8Q3 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pcp4l1Q6W8Q3 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pcp4l1Q6W8Q3 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pcp4l1Q6W8Q3 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pcp4l1Q6W8Q3 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Pcp4l1Q6W8Q3 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pcp4l1Q6W8Q3 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pcp4l1Q6W8Q3 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pcp4l1Q6W8Q3 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pcp4l1Q6W8Q3 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pcp4l1Q6W8Q3 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pcp4l1Q6W8Q3 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pcp4l1Q6W8Q3 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pcp4l1Q6W8Q3 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pcp4l1Q6W8Q3 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pcp4l1Q6W8Q3 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pcp4l1Q6W8Q3 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pcp4l1Q6W8Q3 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pcp4l1Q6W8Q3 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pcp4l1Q6W8Q3 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pcp4l1Q6W8Q3 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pcp4l1Q6W8Q3 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pcp4l1Q6W8Q3 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pcp4l1Q6W8Q3 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pcp4l1Q6W8Q3 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pcp4l1Q6W8Q3 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pcp4l1Q6W8Q3 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pcp4l1Q6W8Q3 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pcp4l1Q6W8Q3 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pcp4l1Q6W8Q3 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pcp4l1Q6W8Q3 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pcp4l1Q6W8Q3 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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