Protein–RNA interactions for Protein: Q6T3U4

Npc1l1, Niemann-Pick C1-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npc1l1Q6T3U4 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Npc1l1Q6T3U4 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Npc1l1Q6T3U4 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Npc1l1Q6T3U4 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Npc1l1Q6T3U4 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Npc1l1Q6T3U4 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Npc1l1Q6T3U4 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Npc1l1Q6T3U4 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Npc1l1Q6T3U4 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Npc1l1Q6T3U4 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Npc1l1Q6T3U4 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Npc1l1Q6T3U4 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Npc1l1Q6T3U4 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Npc1l1Q6T3U4 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Npc1l1Q6T3U4 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Npc1l1Q6T3U4 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Npc1l1Q6T3U4 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Npc1l1Q6T3U4 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Npc1l1Q6T3U4 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Npc1l1Q6T3U4 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Npc1l1Q6T3U4 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Npc1l1Q6T3U4 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Npc1l1Q6T3U4 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Npc1l1Q6T3U4 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Npc1l1Q6T3U4 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Npc1l1Q6T3U4 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Npc1l1Q6T3U4 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Npc1l1Q6T3U4 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Npc1l1Q6T3U4 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Npc1l1Q6T3U4 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Npc1l1Q6T3U4 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Npc1l1Q6T3U4 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Npc1l1Q6T3U4 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Npc1l1Q6T3U4 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Npc1l1Q6T3U4 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Npc1l1Q6T3U4 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Npc1l1Q6T3U4 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Npc1l1Q6T3U4 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Npc1l1Q6T3U4 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Npc1l1Q6T3U4 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Npc1l1Q6T3U4 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Npc1l1Q6T3U4 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Npc1l1Q6T3U4 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Npc1l1Q6T3U4 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Npc1l1Q6T3U4 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Npc1l1Q6T3U4 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Npc1l1Q6T3U4 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Npc1l1Q6T3U4 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Npc1l1Q6T3U4 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Npc1l1Q6T3U4 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Npc1l1Q6T3U4 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Npc1l1Q6T3U4 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Npc1l1Q6T3U4 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Npc1l1Q6T3U4 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Npc1l1Q6T3U4 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Npc1l1Q6T3U4 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Npc1l1Q6T3U4 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Npc1l1Q6T3U4 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Npc1l1Q6T3U4 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Npc1l1Q6T3U4 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Npc1l1Q6T3U4 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Npc1l1Q6T3U4 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Npc1l1Q6T3U4 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Npc1l1Q6T3U4 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Npc1l1Q6T3U4 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Npc1l1Q6T3U4 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Npc1l1Q6T3U4 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Npc1l1Q6T3U4 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Npc1l1Q6T3U4 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Npc1l1Q6T3U4 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Npc1l1Q6T3U4 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Npc1l1Q6T3U4 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Npc1l1Q6T3U4 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Npc1l1Q6T3U4 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Npc1l1Q6T3U4 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Npc1l1Q6T3U4 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Npc1l1Q6T3U4 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Npc1l1Q6T3U4 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Npc1l1Q6T3U4 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Npc1l1Q6T3U4 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Npc1l1Q6T3U4 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Npc1l1Q6T3U4 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Npc1l1Q6T3U4 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Npc1l1Q6T3U4 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Npc1l1Q6T3U4 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Npc1l1Q6T3U4 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Npc1l1Q6T3U4 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Npc1l1Q6T3U4 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Npc1l1Q6T3U4 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Npc1l1Q6T3U4 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Npc1l1Q6T3U4 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Npc1l1Q6T3U4 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Npc1l1Q6T3U4 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Npc1l1Q6T3U4 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Npc1l1Q6T3U4 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Npc1l1Q6T3U4 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Npc1l1Q6T3U4 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Npc1l1Q6T3U4 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Npc1l1Q6T3U4 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Npc1l1Q6T3U4 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms