Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHZ8

Kcnip4, Kv channel-interacting protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnip4Q6PHZ8 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Kcnip4Q6PHZ8 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Kcnip4Q6PHZ8 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Kcnip4Q6PHZ8 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Kcnip4Q6PHZ8 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Kcnip4Q6PHZ8 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Kcnip4Q6PHZ8 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Kcnip4Q6PHZ8 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Kcnip4Q6PHZ8 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Kcnip4Q6PHZ8 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Kcnip4Q6PHZ8 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Kcnip4Q6PHZ8 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Kcnip4Q6PHZ8 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Kcnip4Q6PHZ8 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Kcnip4Q6PHZ8 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Kcnip4Q6PHZ8 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Kcnip4Q6PHZ8 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Kcnip4Q6PHZ8 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Kcnip4Q6PHZ8 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Kcnip4Q6PHZ8 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Kcnip4Q6PHZ8 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Kcnip4Q6PHZ8 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Kcnip4Q6PHZ8 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Kcnip4Q6PHZ8 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Kcnip4Q6PHZ8 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Kcnip4Q6PHZ8 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Kcnip4Q6PHZ8 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Kcnip4Q6PHZ8 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Kcnip4Q6PHZ8 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Kcnip4Q6PHZ8 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Kcnip4Q6PHZ8 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Kcnip4Q6PHZ8 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Kcnip4Q6PHZ8 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Kcnip4Q6PHZ8 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Kcnip4Q6PHZ8 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Kcnip4Q6PHZ8 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Kcnip4Q6PHZ8 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Kcnip4Q6PHZ8 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Kcnip4Q6PHZ8 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Kcnip4Q6PHZ8 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Kcnip4Q6PHZ8 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Kcnip4Q6PHZ8 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Kcnip4Q6PHZ8 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Kcnip4Q6PHZ8 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Kcnip4Q6PHZ8 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Kcnip4Q6PHZ8 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Kcnip4Q6PHZ8 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Kcnip4Q6PHZ8 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Kcnip4Q6PHZ8 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Kcnip4Q6PHZ8 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Kcnip4Q6PHZ8 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Kcnip4Q6PHZ8 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Kcnip4Q6PHZ8 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Kcnip4Q6PHZ8 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Kcnip4Q6PHZ8 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Kcnip4Q6PHZ8 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Kcnip4Q6PHZ8 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Kcnip4Q6PHZ8 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Kcnip4Q6PHZ8 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Kcnip4Q6PHZ8 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Kcnip4Q6PHZ8 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Kcnip4Q6PHZ8 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Kcnip4Q6PHZ8 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Kcnip4Q6PHZ8 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Kcnip4Q6PHZ8 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Kcnip4Q6PHZ8 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Kcnip4Q6PHZ8 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Kcnip4Q6PHZ8 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Kcnip4Q6PHZ8 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Kcnip4Q6PHZ8 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Kcnip4Q6PHZ8 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Kcnip4Q6PHZ8 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Kcnip4Q6PHZ8 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Kcnip4Q6PHZ8 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Kcnip4Q6PHZ8 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Kcnip4Q6PHZ8 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Kcnip4Q6PHZ8 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Kcnip4Q6PHZ8 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Kcnip4Q6PHZ8 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Kcnip4Q6PHZ8 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Kcnip4Q6PHZ8 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Kcnip4Q6PHZ8 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Kcnip4Q6PHZ8 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Kcnip4Q6PHZ8 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Kcnip4Q6PHZ8 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Kcnip4Q6PHZ8 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Kcnip4Q6PHZ8 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Kcnip4Q6PHZ8 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Kcnip4Q6PHZ8 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Kcnip4Q6PHZ8 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Kcnip4Q6PHZ8 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Kcnip4Q6PHZ8 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Kcnip4Q6PHZ8 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Kcnip4Q6PHZ8 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Kcnip4Q6PHZ8 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Kcnip4Q6PHZ8 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Kcnip4Q6PHZ8 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Kcnip4Q6PHZ8 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Kcnip4Q6PHZ8 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Kcnip4Q6PHZ8 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms