Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDM4

Ccdc36, Interactor of HORMAD1 protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc36Q6PDM4 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc36Q6PDM4 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc36Q6PDM4 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc36Q6PDM4 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc36Q6PDM4 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc36Q6PDM4 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc36Q6PDM4 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc36Q6PDM4 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc36Q6PDM4 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc36Q6PDM4 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc36Q6PDM4 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc36Q6PDM4 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc36Q6PDM4 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc36Q6PDM4 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc36Q6PDM4 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc36Q6PDM4 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc36Q6PDM4 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc36Q6PDM4 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc36Q6PDM4 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc36Q6PDM4 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc36Q6PDM4 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc36Q6PDM4 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc36Q6PDM4 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc36Q6PDM4 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc36Q6PDM4 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc36Q6PDM4 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc36Q6PDM4 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc36Q6PDM4 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc36Q6PDM4 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc36Q6PDM4 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc36Q6PDM4 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc36Q6PDM4 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc36Q6PDM4 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc36Q6PDM4 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc36Q6PDM4 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc36Q6PDM4 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc36Q6PDM4 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc36Q6PDM4 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc36Q6PDM4 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc36Q6PDM4 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc36Q6PDM4 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc36Q6PDM4 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc36Q6PDM4 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc36Q6PDM4 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc36Q6PDM4 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc36Q6PDM4 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc36Q6PDM4 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc36Q6PDM4 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc36Q6PDM4 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc36Q6PDM4 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc36Q6PDM4 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc36Q6PDM4 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc36Q6PDM4 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc36Q6PDM4 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc36Q6PDM4 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc36Q6PDM4 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc36Q6PDM4 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc36Q6PDM4 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc36Q6PDM4 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc36Q6PDM4 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc36Q6PDM4 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc36Q6PDM4 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc36Q6PDM4 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc36Q6PDM4 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc36Q6PDM4 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc36Q6PDM4 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc36Q6PDM4 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc36Q6PDM4 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc36Q6PDM4 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc36Q6PDM4 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc36Q6PDM4 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc36Q6PDM4 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc36Q6PDM4 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc36Q6PDM4 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc36Q6PDM4 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc36Q6PDM4 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc36Q6PDM4 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc36Q6PDM4 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc36Q6PDM4 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc36Q6PDM4 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc36Q6PDM4 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc36Q6PDM4 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc36Q6PDM4 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc36Q6PDM4 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc36Q6PDM4 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc36Q6PDM4 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc36Q6PDM4 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc36Q6PDM4 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc36Q6PDM4 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc36Q6PDM4 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc36Q6PDM4 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc36Q6PDM4 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc36Q6PDM4 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc36Q6PDM4 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc36Q6PDM4 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc36Q6PDM4 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc36Q6PDM4 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc36Q6PDM4 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc36Q6PDM4 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc36Q6PDM4 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms