Protein–RNA interactions for Protein: Q6PAJ1

Bcr, Breakpoint cluster region protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BcrQ6PAJ1 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BcrQ6PAJ1 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BcrQ6PAJ1 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC21.28■■□□□ 1
BcrQ6PAJ1 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BcrQ6PAJ1 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
BcrQ6PAJ1 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
BcrQ6PAJ1 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BcrQ6PAJ1 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BcrQ6PAJ1 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BcrQ6PAJ1 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BcrQ6PAJ1 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BcrQ6PAJ1 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
BcrQ6PAJ1 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BcrQ6PAJ1 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BcrQ6PAJ1 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BcrQ6PAJ1 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
BcrQ6PAJ1 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BcrQ6PAJ1 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC21.27■■□□□ 1
BcrQ6PAJ1 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BcrQ6PAJ1 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
BcrQ6PAJ1 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BcrQ6PAJ1 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BcrQ6PAJ1 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
BcrQ6PAJ1 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BcrQ6PAJ1 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BcrQ6PAJ1 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BcrQ6PAJ1 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
BcrQ6PAJ1 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BcrQ6PAJ1 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
BcrQ6PAJ1 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BcrQ6PAJ1 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BcrQ6PAJ1 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BcrQ6PAJ1 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
BcrQ6PAJ1 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
BcrQ6PAJ1 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BcrQ6PAJ1 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BcrQ6PAJ1 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
BcrQ6PAJ1 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BcrQ6PAJ1 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BcrQ6PAJ1 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BcrQ6PAJ1 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BcrQ6PAJ1 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BcrQ6PAJ1 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BcrQ6PAJ1 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BcrQ6PAJ1 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BcrQ6PAJ1 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BcrQ6PAJ1 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BcrQ6PAJ1 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BcrQ6PAJ1 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
BcrQ6PAJ1 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BcrQ6PAJ1 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
BcrQ6PAJ1 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
BcrQ6PAJ1 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
BcrQ6PAJ1 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
BcrQ6PAJ1 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BcrQ6PAJ1 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BcrQ6PAJ1 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BcrQ6PAJ1 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BcrQ6PAJ1 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BcrQ6PAJ1 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BcrQ6PAJ1 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BcrQ6PAJ1 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BcrQ6PAJ1 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BcrQ6PAJ1 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BcrQ6PAJ1 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
BcrQ6PAJ1 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BcrQ6PAJ1 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
BcrQ6PAJ1 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
BcrQ6PAJ1 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BcrQ6PAJ1 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
BcrQ6PAJ1 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
BcrQ6PAJ1 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BcrQ6PAJ1 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BcrQ6PAJ1 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
BcrQ6PAJ1 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BcrQ6PAJ1 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BcrQ6PAJ1 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BcrQ6PAJ1 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
BcrQ6PAJ1 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
BcrQ6PAJ1 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BcrQ6PAJ1 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BcrQ6PAJ1 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
BcrQ6PAJ1 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BcrQ6PAJ1 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BcrQ6PAJ1 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
BcrQ6PAJ1 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
BcrQ6PAJ1 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
BcrQ6PAJ1 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
BcrQ6PAJ1 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
BcrQ6PAJ1 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
BcrQ6PAJ1 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
BcrQ6PAJ1 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
BcrQ6PAJ1 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
BcrQ6PAJ1 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
BcrQ6PAJ1 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
BcrQ6PAJ1 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
BcrQ6PAJ1 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
BcrQ6PAJ1 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
BcrQ6PAJ1 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
BcrQ6PAJ1 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms