Protein–RNA interactions for Protein: Q6P8N9

Cyp2d40, Cytochrome P450, family 2, subfamily d, polypeptide 40, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp2d40Q6P8N9 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cyp2d40Q6P8N9 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cyp2d40Q6P8N9 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cyp2d40Q6P8N9 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cyp2d40Q6P8N9 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cyp2d40Q6P8N9 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cyp2d40Q6P8N9 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cyp2d40Q6P8N9 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cyp2d40Q6P8N9 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cyp2d40Q6P8N9 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cyp2d40Q6P8N9 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cyp2d40Q6P8N9 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cyp2d40Q6P8N9 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Cyp2d40Q6P8N9 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cyp2d40Q6P8N9 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cyp2d40Q6P8N9 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cyp2d40Q6P8N9 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cyp2d40Q6P8N9 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cyp2d40Q6P8N9 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cyp2d40Q6P8N9 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cyp2d40Q6P8N9 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Cyp2d40Q6P8N9 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cyp2d40Q6P8N9 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cyp2d40Q6P8N9 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cyp2d40Q6P8N9 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cyp2d40Q6P8N9 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cyp2d40Q6P8N9 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cyp2d40Q6P8N9 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cyp2d40Q6P8N9 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cyp2d40Q6P8N9 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Cyp2d40Q6P8N9 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cyp2d40Q6P8N9 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cyp2d40Q6P8N9 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cyp2d40Q6P8N9 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cyp2d40Q6P8N9 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cyp2d40Q6P8N9 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cyp2d40Q6P8N9 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cyp2d40Q6P8N9 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cyp2d40Q6P8N9 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cyp2d40Q6P8N9 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cyp2d40Q6P8N9 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cyp2d40Q6P8N9 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cyp2d40Q6P8N9 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cyp2d40Q6P8N9 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cyp2d40Q6P8N9 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cyp2d40Q6P8N9 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cyp2d40Q6P8N9 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cyp2d40Q6P8N9 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cyp2d40Q6P8N9 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cyp2d40Q6P8N9 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cyp2d40Q6P8N9 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cyp2d40Q6P8N9 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cyp2d40Q6P8N9 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cyp2d40Q6P8N9 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cyp2d40Q6P8N9 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cyp2d40Q6P8N9 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cyp2d40Q6P8N9 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cyp2d40Q6P8N9 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Cyp2d40Q6P8N9 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cyp2d40Q6P8N9 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cyp2d40Q6P8N9 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cyp2d40Q6P8N9 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Cyp2d40Q6P8N9 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Cyp2d40Q6P8N9 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cyp2d40Q6P8N9 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cyp2d40Q6P8N9 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cyp2d40Q6P8N9 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cyp2d40Q6P8N9 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cyp2d40Q6P8N9 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cyp2d40Q6P8N9 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cyp2d40Q6P8N9 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cyp2d40Q6P8N9 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cyp2d40Q6P8N9 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cyp2d40Q6P8N9 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cyp2d40Q6P8N9 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cyp2d40Q6P8N9 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cyp2d40Q6P8N9 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cyp2d40Q6P8N9 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cyp2d40Q6P8N9 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cyp2d40Q6P8N9 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cyp2d40Q6P8N9 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cyp2d40Q6P8N9 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cyp2d40Q6P8N9 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Cyp2d40Q6P8N9 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Cyp2d40Q6P8N9 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cyp2d40Q6P8N9 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cyp2d40Q6P8N9 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cyp2d40Q6P8N9 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cyp2d40Q6P8N9 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Cyp2d40Q6P8N9 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cyp2d40Q6P8N9 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cyp2d40Q6P8N9 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cyp2d40Q6P8N9 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cyp2d40Q6P8N9 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cyp2d40Q6P8N9 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cyp2d40Q6P8N9 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cyp2d40Q6P8N9 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cyp2d40Q6P8N9 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cyp2d40Q6P8N9 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cyp2d40Q6P8N9 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms