Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZR2

Msantd2, Myb/SANT-like DNA-binding domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msantd2Q6NZR2 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Msantd2Q6NZR2 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Msantd2Q6NZR2 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Msantd2Q6NZR2 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Msantd2Q6NZR2 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Msantd2Q6NZR2 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Msantd2Q6NZR2 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Msantd2Q6NZR2 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Msantd2Q6NZR2 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Msantd2Q6NZR2 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Msantd2Q6NZR2 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Msantd2Q6NZR2 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Msantd2Q6NZR2 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Msantd2Q6NZR2 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Msantd2Q6NZR2 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Msantd2Q6NZR2 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Msantd2Q6NZR2 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Msantd2Q6NZR2 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Msantd2Q6NZR2 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Msantd2Q6NZR2 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Msantd2Q6NZR2 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Msantd2Q6NZR2 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Msantd2Q6NZR2 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Msantd2Q6NZR2 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Msantd2Q6NZR2 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Msantd2Q6NZR2 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Msantd2Q6NZR2 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Msantd2Q6NZR2 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Msantd2Q6NZR2 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Msantd2Q6NZR2 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Msantd2Q6NZR2 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Msantd2Q6NZR2 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Msantd2Q6NZR2 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Msantd2Q6NZR2 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Msantd2Q6NZR2 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Msantd2Q6NZR2 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Msantd2Q6NZR2 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Msantd2Q6NZR2 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Msantd2Q6NZR2 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Msantd2Q6NZR2 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Msantd2Q6NZR2 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Msantd2Q6NZR2 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Msantd2Q6NZR2 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Msantd2Q6NZR2 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Msantd2Q6NZR2 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Msantd2Q6NZR2 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Msantd2Q6NZR2 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Msantd2Q6NZR2 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Msantd2Q6NZR2 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Msantd2Q6NZR2 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Msantd2Q6NZR2 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Msantd2Q6NZR2 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Msantd2Q6NZR2 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Msantd2Q6NZR2 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Msantd2Q6NZR2 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Msantd2Q6NZR2 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Msantd2Q6NZR2 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Msantd2Q6NZR2 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Msantd2Q6NZR2 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Msantd2Q6NZR2 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Msantd2Q6NZR2 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Msantd2Q6NZR2 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Msantd2Q6NZR2 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Msantd2Q6NZR2 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Msantd2Q6NZR2 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Msantd2Q6NZR2 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Msantd2Q6NZR2 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Msantd2Q6NZR2 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Msantd2Q6NZR2 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Msantd2Q6NZR2 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Msantd2Q6NZR2 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Msantd2Q6NZR2 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Msantd2Q6NZR2 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Msantd2Q6NZR2 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Msantd2Q6NZR2 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Msantd2Q6NZR2 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Msantd2Q6NZR2 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Msantd2Q6NZR2 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Msantd2Q6NZR2 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Msantd2Q6NZR2 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Msantd2Q6NZR2 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Msantd2Q6NZR2 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Msantd2Q6NZR2 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Msantd2Q6NZR2 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Msantd2Q6NZR2 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Msantd2Q6NZR2 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Msantd2Q6NZR2 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Msantd2Q6NZR2 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Msantd2Q6NZR2 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Msantd2Q6NZR2 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Msantd2Q6NZR2 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Msantd2Q6NZR2 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Msantd2Q6NZR2 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Msantd2Q6NZR2 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Msantd2Q6NZR2 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Msantd2Q6NZR2 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Msantd2Q6NZR2 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Msantd2Q6NZR2 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Msantd2Q6NZR2 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Msantd2Q6NZR2 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms