Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXK8

Asic1, Acid-sensing ion channel 1, mousemouse

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Asic1Q6NXK8 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Asic1Q6NXK8 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Asic1Q6NXK8 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Asic1Q6NXK8 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Asic1Q6NXK8 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Asic1Q6NXK8 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Asic1Q6NXK8 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Asic1Q6NXK8 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Asic1Q6NXK8 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Asic1Q6NXK8 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Asic1Q6NXK8 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Asic1Q6NXK8 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Asic1Q6NXK8 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Asic1Q6NXK8 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Asic1Q6NXK8 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Asic1Q6NXK8 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Asic1Q6NXK8 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Asic1Q6NXK8 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Asic1Q6NXK8 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Asic1Q6NXK8 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Asic1Q6NXK8 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Asic1Q6NXK8 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Asic1Q6NXK8 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Asic1Q6NXK8 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Asic1Q6NXK8 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Asic1Q6NXK8 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Asic1Q6NXK8 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Asic1Q6NXK8 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Asic1Q6NXK8 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Asic1Q6NXK8 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Asic1Q6NXK8 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Asic1Q6NXK8 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Asic1Q6NXK8 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Asic1Q6NXK8 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Asic1Q6NXK8 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Asic1Q6NXK8 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Asic1Q6NXK8 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Asic1Q6NXK8 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Asic1Q6NXK8 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Asic1Q6NXK8 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Asic1Q6NXK8 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Asic1Q6NXK8 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Asic1Q6NXK8 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Asic1Q6NXK8 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Asic1Q6NXK8 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Asic1Q6NXK8 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Asic1Q6NXK8 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Asic1Q6NXK8 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Asic1Q6NXK8 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Asic1Q6NXK8 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Asic1Q6NXK8 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Asic1Q6NXK8 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Asic1Q6NXK8 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Asic1Q6NXK8 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Asic1Q6NXK8 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Asic1Q6NXK8 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Asic1Q6NXK8 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Asic1Q6NXK8 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Asic1Q6NXK8 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Asic1Q6NXK8 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Asic1Q6NXK8 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Asic1Q6NXK8 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Asic1Q6NXK8 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Asic1Q6NXK8 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Asic1Q6NXK8 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Asic1Q6NXK8 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Asic1Q6NXK8 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Asic1Q6NXK8 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Asic1Q6NXK8 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Asic1Q6NXK8 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Asic1Q6NXK8 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Asic1Q6NXK8 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Asic1Q6NXK8 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Asic1Q6NXK8 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Asic1Q6NXK8 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Asic1Q6NXK8 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Asic1Q6NXK8 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Asic1Q6NXK8 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Asic1Q6NXK8 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Asic1Q6NXK8 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Asic1Q6NXK8 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Asic1Q6NXK8 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Asic1Q6NXK8 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Asic1Q6NXK8 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Asic1Q6NXK8 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Asic1Q6NXK8 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Asic1Q6NXK8 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Asic1Q6NXK8 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Asic1Q6NXK8 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Asic1Q6NXK8 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Asic1Q6NXK8 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Asic1Q6NXK8 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Asic1Q6NXK8 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Asic1Q6NXK8 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Asic1Q6NXK8 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Asic1Q6NXK8 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Asic1Q6NXK8 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Asic1Q6NXK8 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Asic1Q6NXK8 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Asic1Q6NXK8 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms