Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVF9

Cpsf6, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpsf6Q6NVF9 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cpsf6Q6NVF9 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cpsf6Q6NVF9 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cpsf6Q6NVF9 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cpsf6Q6NVF9 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cpsf6Q6NVF9 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cpsf6Q6NVF9 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cpsf6Q6NVF9 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cpsf6Q6NVF9 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cpsf6Q6NVF9 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cpsf6Q6NVF9 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cpsf6Q6NVF9 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Cpsf6Q6NVF9 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cpsf6Q6NVF9 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cpsf6Q6NVF9 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Cpsf6Q6NVF9 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cpsf6Q6NVF9 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cpsf6Q6NVF9 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cpsf6Q6NVF9 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cpsf6Q6NVF9 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cpsf6Q6NVF9 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cpsf6Q6NVF9 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cpsf6Q6NVF9 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cpsf6Q6NVF9 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cpsf6Q6NVF9 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cpsf6Q6NVF9 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cpsf6Q6NVF9 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cpsf6Q6NVF9 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cpsf6Q6NVF9 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cpsf6Q6NVF9 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cpsf6Q6NVF9 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cpsf6Q6NVF9 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cpsf6Q6NVF9 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cpsf6Q6NVF9 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cpsf6Q6NVF9 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cpsf6Q6NVF9 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cpsf6Q6NVF9 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cpsf6Q6NVF9 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cpsf6Q6NVF9 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cpsf6Q6NVF9 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cpsf6Q6NVF9 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cpsf6Q6NVF9 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cpsf6Q6NVF9 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cpsf6Q6NVF9 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Cpsf6Q6NVF9 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cpsf6Q6NVF9 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Cpsf6Q6NVF9 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cpsf6Q6NVF9 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cpsf6Q6NVF9 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cpsf6Q6NVF9 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cpsf6Q6NVF9 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cpsf6Q6NVF9 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Cpsf6Q6NVF9 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cpsf6Q6NVF9 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Cpsf6Q6NVF9 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Cpsf6Q6NVF9 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Cpsf6Q6NVF9 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Cpsf6Q6NVF9 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Cpsf6Q6NVF9 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cpsf6Q6NVF9 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cpsf6Q6NVF9 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cpsf6Q6NVF9 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cpsf6Q6NVF9 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cpsf6Q6NVF9 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cpsf6Q6NVF9 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cpsf6Q6NVF9 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cpsf6Q6NVF9 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cpsf6Q6NVF9 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cpsf6Q6NVF9 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cpsf6Q6NVF9 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cpsf6Q6NVF9 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cpsf6Q6NVF9 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cpsf6Q6NVF9 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cpsf6Q6NVF9 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cpsf6Q6NVF9 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cpsf6Q6NVF9 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cpsf6Q6NVF9 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cpsf6Q6NVF9 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cpsf6Q6NVF9 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cpsf6Q6NVF9 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Cpsf6Q6NVF9 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cpsf6Q6NVF9 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cpsf6Q6NVF9 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cpsf6Q6NVF9 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cpsf6Q6NVF9 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cpsf6Q6NVF9 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cpsf6Q6NVF9 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cpsf6Q6NVF9 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cpsf6Q6NVF9 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cpsf6Q6NVF9 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cpsf6Q6NVF9 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cpsf6Q6NVF9 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cpsf6Q6NVF9 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cpsf6Q6NVF9 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cpsf6Q6NVF9 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cpsf6Q6NVF9 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cpsf6Q6NVF9 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cpsf6Q6NVF9 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cpsf6Q6NVF9 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cpsf6Q6NVF9 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms