Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSQ7

Ltv1, Protein LTV1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 470 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ltv1Q6NSQ7 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ltv1Q6NSQ7 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ltv1Q6NSQ7 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ltv1Q6NSQ7 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ltv1Q6NSQ7 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ltv1Q6NSQ7 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ltv1Q6NSQ7 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ltv1Q6NSQ7 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ltv1Q6NSQ7 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ltv1Q6NSQ7 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Ltv1Q6NSQ7 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Ltv1Q6NSQ7 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Ltv1Q6NSQ7 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ltv1Q6NSQ7 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ltv1Q6NSQ7 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ltv1Q6NSQ7 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ltv1Q6NSQ7 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ltv1Q6NSQ7 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ltv1Q6NSQ7 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ltv1Q6NSQ7 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ltv1Q6NSQ7 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ltv1Q6NSQ7 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ltv1Q6NSQ7 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ltv1Q6NSQ7 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Ltv1Q6NSQ7 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ltv1Q6NSQ7 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ltv1Q6NSQ7 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ltv1Q6NSQ7 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ltv1Q6NSQ7 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ltv1Q6NSQ7 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ltv1Q6NSQ7 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ltv1Q6NSQ7 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Ltv1Q6NSQ7 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ltv1Q6NSQ7 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ltv1Q6NSQ7 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ltv1Q6NSQ7 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ltv1Q6NSQ7 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ltv1Q6NSQ7 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ltv1Q6NSQ7 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ltv1Q6NSQ7 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ltv1Q6NSQ7 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ltv1Q6NSQ7 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ltv1Q6NSQ7 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ltv1Q6NSQ7 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ltv1Q6NSQ7 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ltv1Q6NSQ7 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ltv1Q6NSQ7 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ltv1Q6NSQ7 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ltv1Q6NSQ7 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ltv1Q6NSQ7 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ltv1Q6NSQ7 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ltv1Q6NSQ7 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ltv1Q6NSQ7 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ltv1Q6NSQ7 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ltv1Q6NSQ7 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ltv1Q6NSQ7 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ltv1Q6NSQ7 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ltv1Q6NSQ7 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ltv1Q6NSQ7 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ltv1Q6NSQ7 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ltv1Q6NSQ7 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ltv1Q6NSQ7 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ltv1Q6NSQ7 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ltv1Q6NSQ7 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ltv1Q6NSQ7 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ltv1Q6NSQ7 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ltv1Q6NSQ7 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ltv1Q6NSQ7 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ltv1Q6NSQ7 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ltv1Q6NSQ7 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ltv1Q6NSQ7 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ltv1Q6NSQ7 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Ltv1Q6NSQ7 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ltv1Q6NSQ7 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ltv1Q6NSQ7 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ltv1Q6NSQ7 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ltv1Q6NSQ7 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ltv1Q6NSQ7 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ltv1Q6NSQ7 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ltv1Q6NSQ7 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ltv1Q6NSQ7 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ltv1Q6NSQ7 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ltv1Q6NSQ7 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ltv1Q6NSQ7 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ltv1Q6NSQ7 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ltv1Q6NSQ7 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ltv1Q6NSQ7 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Ltv1Q6NSQ7 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Ltv1Q6NSQ7 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ltv1Q6NSQ7 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ltv1Q6NSQ7 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ltv1Q6NSQ7 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ltv1Q6NSQ7 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ltv1Q6NSQ7 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ltv1Q6NSQ7 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ltv1Q6NSQ7 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ltv1Q6NSQ7 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ltv1Q6NSQ7 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ltv1Q6NSQ7 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ltv1Q6NSQ7 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms