Protein–RNA interactions for Protein: Q6KAU8

Atg16l2, Autophagy-related protein 16-2, mousemouse

Predictions only

Length 623 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg16l2Q6KAU8 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Atg16l2Q6KAU8 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Atg16l2Q6KAU8 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Atg16l2Q6KAU8 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Atg16l2Q6KAU8 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Atg16l2Q6KAU8 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Atg16l2Q6KAU8 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Atg16l2Q6KAU8 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Atg16l2Q6KAU8 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Atg16l2Q6KAU8 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Atg16l2Q6KAU8 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Atg16l2Q6KAU8 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Atg16l2Q6KAU8 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Atg16l2Q6KAU8 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Atg16l2Q6KAU8 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Atg16l2Q6KAU8 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Atg16l2Q6KAU8 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Atg16l2Q6KAU8 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Atg16l2Q6KAU8 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Atg16l2Q6KAU8 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Atg16l2Q6KAU8 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Atg16l2Q6KAU8 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Atg16l2Q6KAU8 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Atg16l2Q6KAU8 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Atg16l2Q6KAU8 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Atg16l2Q6KAU8 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Atg16l2Q6KAU8 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Atg16l2Q6KAU8 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Atg16l2Q6KAU8 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Atg16l2Q6KAU8 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Atg16l2Q6KAU8 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Atg16l2Q6KAU8 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Atg16l2Q6KAU8 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Atg16l2Q6KAU8 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Atg16l2Q6KAU8 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Atg16l2Q6KAU8 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Atg16l2Q6KAU8 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Atg16l2Q6KAU8 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Atg16l2Q6KAU8 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Atg16l2Q6KAU8 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Atg16l2Q6KAU8 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Atg16l2Q6KAU8 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Atg16l2Q6KAU8 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Atg16l2Q6KAU8 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Atg16l2Q6KAU8 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Atg16l2Q6KAU8 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Atg16l2Q6KAU8 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Atg16l2Q6KAU8 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Atg16l2Q6KAU8 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Atg16l2Q6KAU8 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Atg16l2Q6KAU8 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Atg16l2Q6KAU8 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Atg16l2Q6KAU8 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Atg16l2Q6KAU8 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Atg16l2Q6KAU8 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Atg16l2Q6KAU8 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Atg16l2Q6KAU8 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Atg16l2Q6KAU8 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Atg16l2Q6KAU8 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Atg16l2Q6KAU8 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Atg16l2Q6KAU8 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Atg16l2Q6KAU8 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Atg16l2Q6KAU8 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Atg16l2Q6KAU8 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Atg16l2Q6KAU8 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Atg16l2Q6KAU8 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Atg16l2Q6KAU8 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Atg16l2Q6KAU8 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Atg16l2Q6KAU8 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Atg16l2Q6KAU8 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Atg16l2Q6KAU8 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Atg16l2Q6KAU8 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Atg16l2Q6KAU8 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Atg16l2Q6KAU8 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Atg16l2Q6KAU8 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Atg16l2Q6KAU8 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Atg16l2Q6KAU8 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Atg16l2Q6KAU8 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atg16l2Q6KAU8 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atg16l2Q6KAU8 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atg16l2Q6KAU8 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Atg16l2Q6KAU8 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atg16l2Q6KAU8 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atg16l2Q6KAU8 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atg16l2Q6KAU8 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Atg16l2Q6KAU8 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Atg16l2Q6KAU8 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atg16l2Q6KAU8 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atg16l2Q6KAU8 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atg16l2Q6KAU8 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atg16l2Q6KAU8 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atg16l2Q6KAU8 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atg16l2Q6KAU8 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atg16l2Q6KAU8 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atg16l2Q6KAU8 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Atg16l2Q6KAU8 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Atg16l2Q6KAU8 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Atg16l2Q6KAU8 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Atg16l2Q6KAU8 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Atg16l2Q6KAU8 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms