Protein–RNA interactions for Protein: Q65CL1

Ctnna3, Catenin alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna3Q65CL1 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ctnna3Q65CL1 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ctnna3Q65CL1 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Ctnna3Q65CL1 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ctnna3Q65CL1 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ctnna3Q65CL1 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ctnna3Q65CL1 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ctnna3Q65CL1 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ctnna3Q65CL1 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ctnna3Q65CL1 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ctnna3Q65CL1 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ctnna3Q65CL1 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ctnna3Q65CL1 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ctnna3Q65CL1 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ctnna3Q65CL1 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ctnna3Q65CL1 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ctnna3Q65CL1 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ctnna3Q65CL1 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ctnna3Q65CL1 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ctnna3Q65CL1 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ctnna3Q65CL1 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ctnna3Q65CL1 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ctnna3Q65CL1 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ctnna3Q65CL1 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Ctnna3Q65CL1 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ctnna3Q65CL1 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ctnna3Q65CL1 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ctnna3Q65CL1 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ctnna3Q65CL1 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ctnna3Q65CL1 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Ctnna3Q65CL1 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ctnna3Q65CL1 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ctnna3Q65CL1 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ctnna3Q65CL1 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ctnna3Q65CL1 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ctnna3Q65CL1 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ctnna3Q65CL1 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ctnna3Q65CL1 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ctnna3Q65CL1 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ctnna3Q65CL1 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ctnna3Q65CL1 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ctnna3Q65CL1 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ctnna3Q65CL1 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ctnna3Q65CL1 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ctnna3Q65CL1 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ctnna3Q65CL1 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ctnna3Q65CL1 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ctnna3Q65CL1 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ctnna3Q65CL1 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ctnna3Q65CL1 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ctnna3Q65CL1 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ctnna3Q65CL1 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ctnna3Q65CL1 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ctnna3Q65CL1 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ctnna3Q65CL1 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ctnna3Q65CL1 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ctnna3Q65CL1 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ctnna3Q65CL1 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ctnna3Q65CL1 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ctnna3Q65CL1 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ctnna3Q65CL1 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ctnna3Q65CL1 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ctnna3Q65CL1 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ctnna3Q65CL1 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ctnna3Q65CL1 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ctnna3Q65CL1 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Ctnna3Q65CL1 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ctnna3Q65CL1 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ctnna3Q65CL1 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ctnna3Q65CL1 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ctnna3Q65CL1 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ctnna3Q65CL1 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ctnna3Q65CL1 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ctnna3Q65CL1 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ctnna3Q65CL1 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ctnna3Q65CL1 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ctnna3Q65CL1 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ctnna3Q65CL1 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ctnna3Q65CL1 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ctnna3Q65CL1 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ctnna3Q65CL1 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ctnna3Q65CL1 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ctnna3Q65CL1 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ctnna3Q65CL1 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ctnna3Q65CL1 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ctnna3Q65CL1 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ctnna3Q65CL1 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ctnna3Q65CL1 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ctnna3Q65CL1 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Ctnna3Q65CL1 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ctnna3Q65CL1 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ctnna3Q65CL1 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ctnna3Q65CL1 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ctnna3Q65CL1 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ctnna3Q65CL1 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ctnna3Q65CL1 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ctnna3Q65CL1 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ctnna3Q65CL1 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ctnna3Q65CL1 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ctnna3Q65CL1 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms