Protein–RNA interactions for Protein: Q64511

Top2b, DNA topoisomerase 2-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2bQ64511 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
Top2bQ64511 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC31.18■■■□□ 2.58
Top2bQ64511 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Top2bQ64511 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Top2bQ64511 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC31.18■■■□□ 2.58
Top2bQ64511 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Top2bQ64511 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Top2bQ64511 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Top2bQ64511 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Top2bQ64511 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Top2bQ64511 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Top2bQ64511 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Top2bQ64511 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Top2bQ64511 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Top2bQ64511 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Top2bQ64511 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Top2bQ64511 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC31.17■■■□□ 2.58
Top2bQ64511 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Top2bQ64511 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Top2bQ64511 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Top2bQ64511 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.16■■■□□ 2.58
Top2bQ64511 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Top2bQ64511 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Top2bQ64511 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Top2bQ64511 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Top2bQ64511 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Top2bQ64511 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Top2bQ64511 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC31.16■■■□□ 2.58
Top2bQ64511 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.16■■■□□ 2.58
Top2bQ64511 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Top2bQ64511 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
Top2bQ64511 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.14■■■□□ 2.58
Top2bQ64511 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
Top2bQ64511 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
Top2bQ64511 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC31.13■■■□□ 2.57
Top2bQ64511 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC31.13■■■□□ 2.57
Top2bQ64511 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
Top2bQ64511 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
Top2bQ64511 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC31.13■■■□□ 2.57
Top2bQ64511 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.13■■■□□ 2.57
Top2bQ64511 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
Top2bQ64511 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
Top2bQ64511 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
Top2bQ64511 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.13■■■□□ 2.57
Top2bQ64511 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC31.13■■■□□ 2.57
Top2bQ64511 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.13■■■□□ 2.57
Top2bQ64511 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
Top2bQ64511 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC31.13■■■□□ 2.57
Top2bQ64511 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
Top2bQ64511 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
Top2bQ64511 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
Top2bQ64511 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
Top2bQ64511 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.12■■■□□ 2.57
Top2bQ64511 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
Top2bQ64511 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
Top2bQ64511 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC31.12■■■□□ 2.57
Top2bQ64511 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
Top2bQ64511 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
Top2bQ64511 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.11■■■□□ 2.57
Top2bQ64511 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC31.11■■■□□ 2.57
Top2bQ64511 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Top2bQ64511 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.1■■■□□ 2.57
Top2bQ64511 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC31.1■■■□□ 2.57
Top2bQ64511 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC31.1■■■□□ 2.57
Top2bQ64511 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC31.1■■■□□ 2.57
Top2bQ64511 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Top2bQ64511 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Top2bQ64511 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC31.1■■■□□ 2.57
Top2bQ64511 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.1■■■□□ 2.57
Top2bQ64511 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Top2bQ64511 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Top2bQ64511 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC31.09■■■□□ 2.57
Top2bQ64511 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC31.09■■■□□ 2.57
Top2bQ64511 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.09■■■□□ 2.57
Top2bQ64511 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Top2bQ64511 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Top2bQ64511 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Top2bQ64511 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Top2bQ64511 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Top2bQ64511 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC31.08■■■□□ 2.57
Top2bQ64511 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC31.08■■■□□ 2.57
Top2bQ64511 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC31.08■■■□□ 2.57
Top2bQ64511 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Top2bQ64511 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Top2bQ64511 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Top2bQ64511 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
Top2bQ64511 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
Top2bQ64511 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC31.07■■■□□ 2.56
Top2bQ64511 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
Top2bQ64511 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
Top2bQ64511 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.06■■■□□ 2.56
Top2bQ64511 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Top2bQ64511 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.06■■■□□ 2.56
Top2bQ64511 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Top2bQ64511 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Top2bQ64511 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC31.06■■■□□ 2.56
Top2bQ64511 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC31.06■■■□□ 2.56
Top2bQ64511 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Top2bQ64511 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.06■■■□□ 2.56
Top2bQ64511 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC31.06■■■□□ 2.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms