Protein–RNA interactions for Protein: Q64347

Clcn1, Chloride channel protein 1, mousemouse

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Length 994 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clcn1Q64347 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Clcn1Q64347 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Clcn1Q64347 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Clcn1Q64347 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Clcn1Q64347 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Clcn1Q64347 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Clcn1Q64347 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Clcn1Q64347 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Clcn1Q64347 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Clcn1Q64347 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Clcn1Q64347 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Clcn1Q64347 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Clcn1Q64347 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Clcn1Q64347 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Clcn1Q64347 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Clcn1Q64347 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Clcn1Q64347 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Clcn1Q64347 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Clcn1Q64347 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Clcn1Q64347 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Clcn1Q64347 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
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Clcn1Q64347 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Clcn1Q64347 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
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Clcn1Q64347 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Clcn1Q64347 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Clcn1Q64347 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Clcn1Q64347 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Clcn1Q64347 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Clcn1Q64347 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Clcn1Q64347 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Clcn1Q64347 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Clcn1Q64347 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Clcn1Q64347 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Clcn1Q64347 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Clcn1Q64347 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Clcn1Q64347 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Clcn1Q64347 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Clcn1Q64347 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
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Clcn1Q64347 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
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Clcn1Q64347 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
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Clcn1Q64347 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
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Clcn1Q64347 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
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Clcn1Q64347 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Clcn1Q64347 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Clcn1Q64347 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Clcn1Q64347 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Clcn1Q64347 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Clcn1Q64347 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Clcn1Q64347 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Clcn1Q64347 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Clcn1Q64347 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Clcn1Q64347 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Clcn1Q64347 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Clcn1Q64347 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
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Clcn1Q64347 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Clcn1Q64347 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Clcn1Q64347 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Clcn1Q64347 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Clcn1Q64347 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Clcn1Q64347 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Clcn1Q64347 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Clcn1Q64347 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Clcn1Q64347 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Clcn1Q64347 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Clcn1Q64347 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Clcn1Q64347 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Clcn1Q64347 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Clcn1Q64347 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Clcn1Q64347 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Clcn1Q64347 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Clcn1Q64347 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
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