Protein–RNA interactions for Protein: Q64253

Ly6e, Lymphocyte antigen 6E, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ly6eQ64253 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ly6eQ64253 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ly6eQ64253 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ly6eQ64253 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ly6eQ64253 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Ly6eQ64253 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ly6eQ64253 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ly6eQ64253 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ly6eQ64253 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ly6eQ64253 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ly6eQ64253 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ly6eQ64253 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ly6eQ64253 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ly6eQ64253 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ly6eQ64253 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ly6eQ64253 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ly6eQ64253 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ly6eQ64253 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ly6eQ64253 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ly6eQ64253 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ly6eQ64253 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ly6eQ64253 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ly6eQ64253 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ly6eQ64253 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ly6eQ64253 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ly6eQ64253 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ly6eQ64253 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ly6eQ64253 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ly6eQ64253 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ly6eQ64253 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ly6eQ64253 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ly6eQ64253 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ly6eQ64253 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ly6eQ64253 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ly6eQ64253 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ly6eQ64253 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ly6eQ64253 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ly6eQ64253 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ly6eQ64253 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ly6eQ64253 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ly6eQ64253 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ly6eQ64253 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ly6eQ64253 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ly6eQ64253 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Ly6eQ64253 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Ly6eQ64253 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Ly6eQ64253 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ly6eQ64253 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ly6eQ64253 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ly6eQ64253 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ly6eQ64253 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ly6eQ64253 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ly6eQ64253 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ly6eQ64253 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ly6eQ64253 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ly6eQ64253 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ly6eQ64253 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ly6eQ64253 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ly6eQ64253 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ly6eQ64253 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ly6eQ64253 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ly6eQ64253 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ly6eQ64253 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ly6eQ64253 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ly6eQ64253 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Ly6eQ64253 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Ly6eQ64253 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ly6eQ64253 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ly6eQ64253 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ly6eQ64253 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ly6eQ64253 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ly6eQ64253 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ly6eQ64253 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ly6eQ64253 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ly6eQ64253 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ly6eQ64253 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Ly6eQ64253 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ly6eQ64253 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ly6eQ64253 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ly6eQ64253 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ly6eQ64253 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ly6eQ64253 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ly6eQ64253 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ly6eQ64253 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ly6eQ64253 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ly6eQ64253 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ly6eQ64253 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ly6eQ64253 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ly6eQ64253 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ly6eQ64253 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ly6eQ64253 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ly6eQ64253 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ly6eQ64253 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ly6eQ64253 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ly6eQ64253 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ly6eQ64253 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ly6eQ64253 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ly6eQ64253 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ly6eQ64253 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ly6eQ64253 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms