Protein–RNA interactions for Protein: Q62447

Ccnc, Cyclin-C, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcncQ62447 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CcncQ62447 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CcncQ62447 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CcncQ62447 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CcncQ62447 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CcncQ62447 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CcncQ62447 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CcncQ62447 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CcncQ62447 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CcncQ62447 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CcncQ62447 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CcncQ62447 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CcncQ62447 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CcncQ62447 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CcncQ62447 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CcncQ62447 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CcncQ62447 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CcncQ62447 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CcncQ62447 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CcncQ62447 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CcncQ62447 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CcncQ62447 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CcncQ62447 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CcncQ62447 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CcncQ62447 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CcncQ62447 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CcncQ62447 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CcncQ62447 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CcncQ62447 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CcncQ62447 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CcncQ62447 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CcncQ62447 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CcncQ62447 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CcncQ62447 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CcncQ62447 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CcncQ62447 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CcncQ62447 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CcncQ62447 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CcncQ62447 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CcncQ62447 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CcncQ62447 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CcncQ62447 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CcncQ62447 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CcncQ62447 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CcncQ62447 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CcncQ62447 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CcncQ62447 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CcncQ62447 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CcncQ62447 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CcncQ62447 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
CcncQ62447 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CcncQ62447 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CcncQ62447 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CcncQ62447 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CcncQ62447 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CcncQ62447 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CcncQ62447 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CcncQ62447 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CcncQ62447 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CcncQ62447 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CcncQ62447 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CcncQ62447 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CcncQ62447 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CcncQ62447 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CcncQ62447 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CcncQ62447 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CcncQ62447 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CcncQ62447 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CcncQ62447 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CcncQ62447 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CcncQ62447 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CcncQ62447 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CcncQ62447 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CcncQ62447 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CcncQ62447 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CcncQ62447 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CcncQ62447 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CcncQ62447 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CcncQ62447 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CcncQ62447 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CcncQ62447 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CcncQ62447 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CcncQ62447 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CcncQ62447 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CcncQ62447 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CcncQ62447 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CcncQ62447 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CcncQ62447 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CcncQ62447 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CcncQ62447 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CcncQ62447 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CcncQ62447 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CcncQ62447 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CcncQ62447 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CcncQ62447 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
CcncQ62447 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CcncQ62447 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CcncQ62447 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CcncQ62447 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CcncQ62447 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms