Protein–RNA interactions for Protein: Q62288

Spock1, Testican-1, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spock1Q62288 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Spock1Q62288 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Spock1Q62288 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Spock1Q62288 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Spock1Q62288 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Spock1Q62288 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Spock1Q62288 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Spock1Q62288 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Spock1Q62288 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Spock1Q62288 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Spock1Q62288 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Spock1Q62288 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Spock1Q62288 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Spock1Q62288 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Spock1Q62288 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Spock1Q62288 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Spock1Q62288 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Spock1Q62288 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Spock1Q62288 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Spock1Q62288 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Spock1Q62288 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Spock1Q62288 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Spock1Q62288 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Spock1Q62288 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Spock1Q62288 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Spock1Q62288 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Spock1Q62288 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Spock1Q62288 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Spock1Q62288 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Spock1Q62288 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Spock1Q62288 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Spock1Q62288 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Spock1Q62288 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Spock1Q62288 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Spock1Q62288 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Spock1Q62288 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Spock1Q62288 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Spock1Q62288 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Spock1Q62288 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Spock1Q62288 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Spock1Q62288 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Spock1Q62288 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Spock1Q62288 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Spock1Q62288 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Spock1Q62288 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Spock1Q62288 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Spock1Q62288 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Spock1Q62288 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Spock1Q62288 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Spock1Q62288 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Spock1Q62288 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Spock1Q62288 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Spock1Q62288 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Spock1Q62288 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Spock1Q62288 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Spock1Q62288 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Spock1Q62288 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Spock1Q62288 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Spock1Q62288 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Spock1Q62288 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Spock1Q62288 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Spock1Q62288 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Spock1Q62288 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Spock1Q62288 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Spock1Q62288 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Spock1Q62288 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Spock1Q62288 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Spock1Q62288 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Spock1Q62288 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Spock1Q62288 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Spock1Q62288 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Spock1Q62288 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Spock1Q62288 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Spock1Q62288 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Spock1Q62288 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Spock1Q62288 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Spock1Q62288 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Spock1Q62288 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Spock1Q62288 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Spock1Q62288 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Spock1Q62288 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Spock1Q62288 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Spock1Q62288 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Spock1Q62288 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Spock1Q62288 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Spock1Q62288 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Spock1Q62288 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Spock1Q62288 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Spock1Q62288 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Spock1Q62288 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Spock1Q62288 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Spock1Q62288 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Spock1Q62288 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Spock1Q62288 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Spock1Q62288 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Spock1Q62288 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Spock1Q62288 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Spock1Q62288 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Spock1Q62288 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Spock1Q62288 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms