Protein–RNA interactions for Protein: Q61450

Gp49a, Mast cell surface glycoprotein Gp49A, mousemouse

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gp49aQ61450 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gp49aQ61450 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gp49aQ61450 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gp49aQ61450 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gp49aQ61450 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gp49aQ61450 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gp49aQ61450 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gp49aQ61450 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gp49aQ61450 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gp49aQ61450 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gp49aQ61450 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Gp49aQ61450 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gp49aQ61450 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gp49aQ61450 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gp49aQ61450 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gp49aQ61450 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gp49aQ61450 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gp49aQ61450 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gp49aQ61450 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gp49aQ61450 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gp49aQ61450 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gp49aQ61450 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gp49aQ61450 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gp49aQ61450 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gp49aQ61450 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Gp49aQ61450 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gp49aQ61450 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gp49aQ61450 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gp49aQ61450 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gp49aQ61450 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gp49aQ61450 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gp49aQ61450 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gp49aQ61450 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gp49aQ61450 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gp49aQ61450 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gp49aQ61450 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gp49aQ61450 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gp49aQ61450 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gp49aQ61450 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gp49aQ61450 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gp49aQ61450 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gp49aQ61450 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gp49aQ61450 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gp49aQ61450 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gp49aQ61450 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gp49aQ61450 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gp49aQ61450 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gp49aQ61450 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gp49aQ61450 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gp49aQ61450 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Gp49aQ61450 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gp49aQ61450 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gp49aQ61450 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gp49aQ61450 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gp49aQ61450 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gp49aQ61450 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gp49aQ61450 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gp49aQ61450 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gp49aQ61450 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gp49aQ61450 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gp49aQ61450 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gp49aQ61450 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gp49aQ61450 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gp49aQ61450 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gp49aQ61450 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gp49aQ61450 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gp49aQ61450 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gp49aQ61450 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gp49aQ61450 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gp49aQ61450 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Gp49aQ61450 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gp49aQ61450 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gp49aQ61450 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gp49aQ61450 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gp49aQ61450 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Gp49aQ61450 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gp49aQ61450 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gp49aQ61450 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Gp49aQ61450 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gp49aQ61450 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gp49aQ61450 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gp49aQ61450 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gp49aQ61450 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gp49aQ61450 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gp49aQ61450 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gp49aQ61450 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gp49aQ61450 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gp49aQ61450 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gp49aQ61450 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gp49aQ61450 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gp49aQ61450 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gp49aQ61450 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Gp49aQ61450 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gp49aQ61450 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gp49aQ61450 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gp49aQ61450 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gp49aQ61450 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gp49aQ61450 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Gp49aQ61450 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gp49aQ61450 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms