Protein–RNA interactions for Protein: Q61409

Pde3b, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, mousemouse

Predictions only

Length 1,100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde3bQ61409 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pde3bQ61409 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pde3bQ61409 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pde3bQ61409 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pde3bQ61409 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pde3bQ61409 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pde3bQ61409 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Pde3bQ61409 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Pde3bQ61409 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Pde3bQ61409 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pde3bQ61409 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Pde3bQ61409 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pde3bQ61409 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Pde3bQ61409 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Pde3bQ61409 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Pde3bQ61409 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pde3bQ61409 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pde3bQ61409 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pde3bQ61409 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pde3bQ61409 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pde3bQ61409 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pde3bQ61409 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pde3bQ61409 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pde3bQ61409 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pde3bQ61409 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pde3bQ61409 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pde3bQ61409 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pde3bQ61409 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pde3bQ61409 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pde3bQ61409 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pde3bQ61409 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pde3bQ61409 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pde3bQ61409 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Pde3bQ61409 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pde3bQ61409 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pde3bQ61409 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pde3bQ61409 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pde3bQ61409 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pde3bQ61409 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pde3bQ61409 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pde3bQ61409 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pde3bQ61409 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pde3bQ61409 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pde3bQ61409 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pde3bQ61409 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pde3bQ61409 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pde3bQ61409 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pde3bQ61409 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pde3bQ61409 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pde3bQ61409 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pde3bQ61409 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pde3bQ61409 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pde3bQ61409 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pde3bQ61409 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pde3bQ61409 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pde3bQ61409 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pde3bQ61409 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pde3bQ61409 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pde3bQ61409 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pde3bQ61409 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pde3bQ61409 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pde3bQ61409 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pde3bQ61409 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pde3bQ61409 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pde3bQ61409 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pde3bQ61409 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pde3bQ61409 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pde3bQ61409 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pde3bQ61409 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pde3bQ61409 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pde3bQ61409 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pde3bQ61409 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pde3bQ61409 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pde3bQ61409 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pde3bQ61409 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pde3bQ61409 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pde3bQ61409 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pde3bQ61409 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pde3bQ61409 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pde3bQ61409 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pde3bQ61409 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Pde3bQ61409 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pde3bQ61409 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pde3bQ61409 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Pde3bQ61409 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Pde3bQ61409 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Pde3bQ61409 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Pde3bQ61409 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pde3bQ61409 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pde3bQ61409 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pde3bQ61409 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pde3bQ61409 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pde3bQ61409 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pde3bQ61409 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pde3bQ61409 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pde3bQ61409 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pde3bQ61409 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pde3bQ61409 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pde3bQ61409 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pde3bQ61409 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms