Protein–RNA interactions for Protein: Q61398

Pcolce, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcolceQ61398 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
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PcolceQ61398 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
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PcolceQ61398 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PcolceQ61398 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PcolceQ61398 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PcolceQ61398 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PcolceQ61398 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PcolceQ61398 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PcolceQ61398 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PcolceQ61398 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PcolceQ61398 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PcolceQ61398 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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PcolceQ61398 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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