Protein–RNA interactions for Protein: Q61060

Foxd3, Forkhead box protein D3, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd3Q61060 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Foxd3Q61060 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Foxd3Q61060 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Foxd3Q61060 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Foxd3Q61060 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Foxd3Q61060 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Foxd3Q61060 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Foxd3Q61060 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Foxd3Q61060 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Foxd3Q61060 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Foxd3Q61060 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Foxd3Q61060 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Foxd3Q61060 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Foxd3Q61060 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Foxd3Q61060 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Foxd3Q61060 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Foxd3Q61060 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Foxd3Q61060 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Foxd3Q61060 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Foxd3Q61060 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Foxd3Q61060 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Foxd3Q61060 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Foxd3Q61060 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Foxd3Q61060 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Foxd3Q61060 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Foxd3Q61060 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Foxd3Q61060 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Foxd3Q61060 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Foxd3Q61060 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Foxd3Q61060 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Foxd3Q61060 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Foxd3Q61060 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Foxd3Q61060 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Foxd3Q61060 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Foxd3Q61060 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Foxd3Q61060 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Foxd3Q61060 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Foxd3Q61060 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Foxd3Q61060 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Foxd3Q61060 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Foxd3Q61060 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Foxd3Q61060 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Foxd3Q61060 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Foxd3Q61060 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Foxd3Q61060 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Foxd3Q61060 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Foxd3Q61060 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Foxd3Q61060 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Foxd3Q61060 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Foxd3Q61060 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Foxd3Q61060 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Foxd3Q61060 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Foxd3Q61060 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Foxd3Q61060 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Foxd3Q61060 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Foxd3Q61060 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Foxd3Q61060 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Foxd3Q61060 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Foxd3Q61060 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Foxd3Q61060 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Foxd3Q61060 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Foxd3Q61060 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Foxd3Q61060 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Foxd3Q61060 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Foxd3Q61060 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Foxd3Q61060 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Foxd3Q61060 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Foxd3Q61060 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Foxd3Q61060 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Foxd3Q61060 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Foxd3Q61060 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Foxd3Q61060 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Foxd3Q61060 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Foxd3Q61060 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Foxd3Q61060 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Foxd3Q61060 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Foxd3Q61060 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Foxd3Q61060 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Foxd3Q61060 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Foxd3Q61060 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Foxd3Q61060 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Foxd3Q61060 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Foxd3Q61060 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Foxd3Q61060 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Foxd3Q61060 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Foxd3Q61060 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Foxd3Q61060 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Foxd3Q61060 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Foxd3Q61060 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Foxd3Q61060 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Foxd3Q61060 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Foxd3Q61060 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Foxd3Q61060 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Foxd3Q61060 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Foxd3Q61060 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Foxd3Q61060 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Foxd3Q61060 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Foxd3Q61060 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Foxd3Q61060 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Foxd3Q61060 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms