Protein–RNA interactions for Protein: Q61009

Scarb1, Scavenger receptor class B member 1, mousemouse

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Length 509 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Scarb1Q61009 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Scarb1Q61009 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Scarb1Q61009 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Scarb1Q61009 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Scarb1Q61009 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Scarb1Q61009 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
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Scarb1Q61009 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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Scarb1Q61009 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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Scarb1Q61009 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Scarb1Q61009 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scarb1Q61009 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scarb1Q61009 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scarb1Q61009 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scarb1Q61009 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Scarb1Q61009 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scarb1Q61009 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Scarb1Q61009 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scarb1Q61009 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Scarb1Q61009 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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