Protein–RNA interactions for Protein: Q60934

Grik1, Glutamate receptor ionotropic, kainate 1, mousemouse

Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik1Q60934 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Grik1Q60934 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Grik1Q60934 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Grik1Q60934 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Grik1Q60934 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Grik1Q60934 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Grik1Q60934 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Grik1Q60934 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Grik1Q60934 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Grik1Q60934 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Grik1Q60934 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Grik1Q60934 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Grik1Q60934 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Grik1Q60934 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Grik1Q60934 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Grik1Q60934 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Grik1Q60934 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Grik1Q60934 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Grik1Q60934 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Grik1Q60934 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Grik1Q60934 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Grik1Q60934 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Grik1Q60934 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Grik1Q60934 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Grik1Q60934 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Grik1Q60934 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Grik1Q60934 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Grik1Q60934 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Grik1Q60934 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Grik1Q60934 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Grik1Q60934 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Grik1Q60934 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Grik1Q60934 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Grik1Q60934 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Grik1Q60934 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Grik1Q60934 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Grik1Q60934 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Grik1Q60934 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Grik1Q60934 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Grik1Q60934 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Grik1Q60934 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Grik1Q60934 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Grik1Q60934 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Grik1Q60934 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Grik1Q60934 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Grik1Q60934 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Grik1Q60934 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Grik1Q60934 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Grik1Q60934 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Grik1Q60934 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Grik1Q60934 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Grik1Q60934 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Grik1Q60934 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Grik1Q60934 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Grik1Q60934 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Grik1Q60934 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Grik1Q60934 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Grik1Q60934 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Grik1Q60934 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Grik1Q60934 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Grik1Q60934 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Grik1Q60934 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Grik1Q60934 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Grik1Q60934 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Grik1Q60934 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Grik1Q60934 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Grik1Q60934 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Grik1Q60934 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Grik1Q60934 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Grik1Q60934 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Grik1Q60934 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Grik1Q60934 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Grik1Q60934 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Grik1Q60934 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Grik1Q60934 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Grik1Q60934 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Grik1Q60934 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Grik1Q60934 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Grik1Q60934 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Grik1Q60934 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Grik1Q60934 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Grik1Q60934 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Grik1Q60934 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Grik1Q60934 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Grik1Q60934 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Grik1Q60934 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Grik1Q60934 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Grik1Q60934 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Grik1Q60934 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Grik1Q60934 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Grik1Q60934 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Grik1Q60934 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Grik1Q60934 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Grik1Q60934 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Grik1Q60934 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Grik1Q60934 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Grik1Q60934 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Grik1Q60934 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Grik1Q60934 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Grik1Q60934 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms