Protein–RNA interactions for Protein: Q60677

Itgae, Integrin alpha-E, mousemouse

Predictions only

Length 1,167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ItgaeQ60677 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
ItgaeQ60677 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ItgaeQ60677 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ItgaeQ60677 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ItgaeQ60677 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ItgaeQ60677 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ItgaeQ60677 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ItgaeQ60677 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ItgaeQ60677 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ItgaeQ60677 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ItgaeQ60677 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ItgaeQ60677 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ItgaeQ60677 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ItgaeQ60677 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ItgaeQ60677 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ItgaeQ60677 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ItgaeQ60677 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ItgaeQ60677 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ItgaeQ60677 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ItgaeQ60677 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ItgaeQ60677 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ItgaeQ60677 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ItgaeQ60677 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
ItgaeQ60677 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ItgaeQ60677 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ItgaeQ60677 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ItgaeQ60677 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ItgaeQ60677 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ItgaeQ60677 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ItgaeQ60677 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
ItgaeQ60677 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ItgaeQ60677 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ItgaeQ60677 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ItgaeQ60677 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ItgaeQ60677 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
ItgaeQ60677 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ItgaeQ60677 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ItgaeQ60677 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
ItgaeQ60677 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ItgaeQ60677 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ItgaeQ60677 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ItgaeQ60677 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
ItgaeQ60677 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ItgaeQ60677 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ItgaeQ60677 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ItgaeQ60677 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ItgaeQ60677 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ItgaeQ60677 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
ItgaeQ60677 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ItgaeQ60677 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ItgaeQ60677 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ItgaeQ60677 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ItgaeQ60677 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ItgaeQ60677 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ItgaeQ60677 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ItgaeQ60677 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ItgaeQ60677 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ItgaeQ60677 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ItgaeQ60677 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ItgaeQ60677 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ItgaeQ60677 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ItgaeQ60677 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ItgaeQ60677 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ItgaeQ60677 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ItgaeQ60677 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ItgaeQ60677 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ItgaeQ60677 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ItgaeQ60677 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
ItgaeQ60677 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ItgaeQ60677 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ItgaeQ60677 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ItgaeQ60677 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ItgaeQ60677 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ItgaeQ60677 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ItgaeQ60677 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ItgaeQ60677 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ItgaeQ60677 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ItgaeQ60677 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ItgaeQ60677 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ItgaeQ60677 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ItgaeQ60677 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ItgaeQ60677 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ItgaeQ60677 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ItgaeQ60677 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ItgaeQ60677 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ItgaeQ60677 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ItgaeQ60677 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ItgaeQ60677 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ItgaeQ60677 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ItgaeQ60677 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
ItgaeQ60677 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
ItgaeQ60677 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
ItgaeQ60677 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
ItgaeQ60677 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
ItgaeQ60677 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
ItgaeQ60677 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ItgaeQ60677 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ItgaeQ60677 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ItgaeQ60677 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ItgaeQ60677 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms