Protein–RNA interactions for Protein: Q5U4C1

Gprasp1, G-protein coupled receptor-associated sorting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gprasp1Q5U4C1 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gprasp1Q5U4C1 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gprasp1Q5U4C1 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gprasp1Q5U4C1 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gprasp1Q5U4C1 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gprasp1Q5U4C1 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gprasp1Q5U4C1 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gprasp1Q5U4C1 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gprasp1Q5U4C1 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gprasp1Q5U4C1 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gprasp1Q5U4C1 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gprasp1Q5U4C1 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gprasp1Q5U4C1 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gprasp1Q5U4C1 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Gprasp1Q5U4C1 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Gprasp1Q5U4C1 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Gprasp1Q5U4C1 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Gprasp1Q5U4C1 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Gprasp1Q5U4C1 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Gprasp1Q5U4C1 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Gprasp1Q5U4C1 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Gprasp1Q5U4C1 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Gprasp1Q5U4C1 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Gprasp1Q5U4C1 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Gprasp1Q5U4C1 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Gprasp1Q5U4C1 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
Gprasp1Q5U4C1 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Gprasp1Q5U4C1 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Gprasp1Q5U4C1 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Gprasp1Q5U4C1 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Gprasp1Q5U4C1 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Gprasp1Q5U4C1 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Gprasp1Q5U4C1 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Gprasp1Q5U4C1 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Gprasp1Q5U4C1 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Gprasp1Q5U4C1 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gprasp1Q5U4C1 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gprasp1Q5U4C1 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gprasp1Q5U4C1 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gprasp1Q5U4C1 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gprasp1Q5U4C1 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gprasp1Q5U4C1 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gprasp1Q5U4C1 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gprasp1Q5U4C1 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gprasp1Q5U4C1 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gprasp1Q5U4C1 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gprasp1Q5U4C1 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gprasp1Q5U4C1 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gprasp1Q5U4C1 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gprasp1Q5U4C1 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gprasp1Q5U4C1 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gprasp1Q5U4C1 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gprasp1Q5U4C1 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gprasp1Q5U4C1 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gprasp1Q5U4C1 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gprasp1Q5U4C1 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gprasp1Q5U4C1 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gprasp1Q5U4C1 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gprasp1Q5U4C1 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gprasp1Q5U4C1 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gprasp1Q5U4C1 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gprasp1Q5U4C1 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Gprasp1Q5U4C1 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Gprasp1Q5U4C1 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Gprasp1Q5U4C1 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Gprasp1Q5U4C1 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Gprasp1Q5U4C1 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Gprasp1Q5U4C1 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Gprasp1Q5U4C1 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Gprasp1Q5U4C1 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Gprasp1Q5U4C1 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Gprasp1Q5U4C1 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Gprasp1Q5U4C1 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Gprasp1Q5U4C1 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Gprasp1Q5U4C1 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Gprasp1Q5U4C1 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Gprasp1Q5U4C1 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Gprasp1Q5U4C1 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Gprasp1Q5U4C1 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gprasp1Q5U4C1 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gprasp1Q5U4C1 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gprasp1Q5U4C1 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gprasp1Q5U4C1 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Gprasp1Q5U4C1 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gprasp1Q5U4C1 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Gprasp1Q5U4C1 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Gprasp1Q5U4C1 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Gprasp1Q5U4C1 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Gprasp1Q5U4C1 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Gprasp1Q5U4C1 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Gprasp1Q5U4C1 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Gprasp1Q5U4C1 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Gprasp1Q5U4C1 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Gprasp1Q5U4C1 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gprasp1Q5U4C1 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gprasp1Q5U4C1 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gprasp1Q5U4C1 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gprasp1Q5U4C1 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gprasp1Q5U4C1 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gprasp1Q5U4C1 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms