Protein–RNA interactions for Protein: Q5U465

Ccdc125, Coiled-coil domain-containing protein 125, mousemouse

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc125Q5U465 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc125Q5U465 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc125Q5U465 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc125Q5U465 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc125Q5U465 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc125Q5U465 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc125Q5U465 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc125Q5U465 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc125Q5U465 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc125Q5U465 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc125Q5U465 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc125Q5U465 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc125Q5U465 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc125Q5U465 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc125Q5U465 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc125Q5U465 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc125Q5U465 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc125Q5U465 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc125Q5U465 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc125Q5U465 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc125Q5U465 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc125Q5U465 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc125Q5U465 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc125Q5U465 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc125Q5U465 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc125Q5U465 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc125Q5U465 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc125Q5U465 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc125Q5U465 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc125Q5U465 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc125Q5U465 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc125Q5U465 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc125Q5U465 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc125Q5U465 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc125Q5U465 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc125Q5U465 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc125Q5U465 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc125Q5U465 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc125Q5U465 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc125Q5U465 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc125Q5U465 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc125Q5U465 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc125Q5U465 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc125Q5U465 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc125Q5U465 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc125Q5U465 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc125Q5U465 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc125Q5U465 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc125Q5U465 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc125Q5U465 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc125Q5U465 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc125Q5U465 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc125Q5U465 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc125Q5U465 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc125Q5U465 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc125Q5U465 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc125Q5U465 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc125Q5U465 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc125Q5U465 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc125Q5U465 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc125Q5U465 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc125Q5U465 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc125Q5U465 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc125Q5U465 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc125Q5U465 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc125Q5U465 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc125Q5U465 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc125Q5U465 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Ccdc125Q5U465 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Ccdc125Q5U465 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Ccdc125Q5U465 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Ccdc125Q5U465 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc125Q5U465 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc125Q5U465 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc125Q5U465 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc125Q5U465 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc125Q5U465 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc125Q5U465 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc125Q5U465 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc125Q5U465 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc125Q5U465 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc125Q5U465 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc125Q5U465 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc125Q5U465 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc125Q5U465 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc125Q5U465 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc125Q5U465 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc125Q5U465 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc125Q5U465 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc125Q5U465 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc125Q5U465 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc125Q5U465 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc125Q5U465 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc125Q5U465 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc125Q5U465 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc125Q5U465 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc125Q5U465 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc125Q5U465 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc125Q5U465 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc125Q5U465 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms