Protein–RNA interactions for Protein: Q5U458

Dnajc11, DnaJ homolog subfamily C member 11, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnajc11Q5U458 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Dnajc11Q5U458 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Dnajc11Q5U458 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Dnajc11Q5U458 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Dnajc11Q5U458 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Dnajc11Q5U458 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Dnajc11Q5U458 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Dnajc11Q5U458 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Dnajc11Q5U458 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Dnajc11Q5U458 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Dnajc11Q5U458 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Dnajc11Q5U458 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Dnajc11Q5U458 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Dnajc11Q5U458 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Dnajc11Q5U458 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Dnajc11Q5U458 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Dnajc11Q5U458 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Dnajc11Q5U458 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Dnajc11Q5U458 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Dnajc11Q5U458 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Dnajc11Q5U458 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Dnajc11Q5U458 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Dnajc11Q5U458 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Dnajc11Q5U458 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Dnajc11Q5U458 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Dnajc11Q5U458 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Dnajc11Q5U458 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Dnajc11Q5U458 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Dnajc11Q5U458 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Dnajc11Q5U458 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Dnajc11Q5U458 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Dnajc11Q5U458 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Dnajc11Q5U458 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Dnajc11Q5U458 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Dnajc11Q5U458 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Dnajc11Q5U458 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Dnajc11Q5U458 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Dnajc11Q5U458 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Dnajc11Q5U458 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Dnajc11Q5U458 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Dnajc11Q5U458 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Dnajc11Q5U458 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Dnajc11Q5U458 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Dnajc11Q5U458 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Dnajc11Q5U458 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Dnajc11Q5U458 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Dnajc11Q5U458 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Dnajc11Q5U458 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Dnajc11Q5U458 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Dnajc11Q5U458 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Dnajc11Q5U458 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Dnajc11Q5U458 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Dnajc11Q5U458 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Dnajc11Q5U458 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Dnajc11Q5U458 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Dnajc11Q5U458 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Dnajc11Q5U458 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Dnajc11Q5U458 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Dnajc11Q5U458 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Dnajc11Q5U458 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Dnajc11Q5U458 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Dnajc11Q5U458 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Dnajc11Q5U458 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Dnajc11Q5U458 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Dnajc11Q5U458 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Dnajc11Q5U458 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Dnajc11Q5U458 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Dnajc11Q5U458 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Dnajc11Q5U458 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Dnajc11Q5U458 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Dnajc11Q5U458 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Dnajc11Q5U458 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Dnajc11Q5U458 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Dnajc11Q5U458 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Dnajc11Q5U458 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Dnajc11Q5U458 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Dnajc11Q5U458 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Dnajc11Q5U458 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Dnajc11Q5U458 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Dnajc11Q5U458 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Dnajc11Q5U458 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Dnajc11Q5U458 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Dnajc11Q5U458 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Dnajc11Q5U458 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Dnajc11Q5U458 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Dnajc11Q5U458 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Dnajc11Q5U458 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Dnajc11Q5U458 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Dnajc11Q5U458 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Dnajc11Q5U458 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Dnajc11Q5U458 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Dnajc11Q5U458 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Dnajc11Q5U458 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Dnajc11Q5U458 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Dnajc11Q5U458 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Dnajc11Q5U458 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Dnajc11Q5U458 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Dnajc11Q5U458 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Dnajc11Q5U458 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Dnajc11Q5U458 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.9 ms