Protein–RNA interactions for Protein: Q5SVD5

Vmn1r196, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r196Q5SVD5 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vmn1r196Q5SVD5 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Vmn1r196Q5SVD5 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vmn1r196Q5SVD5 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vmn1r196Q5SVD5 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vmn1r196Q5SVD5 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vmn1r196Q5SVD5 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vmn1r196Q5SVD5 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Vmn1r196Q5SVD5 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Vmn1r196Q5SVD5 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Vmn1r196Q5SVD5 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vmn1r196Q5SVD5 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vmn1r196Q5SVD5 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vmn1r196Q5SVD5 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vmn1r196Q5SVD5 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vmn1r196Q5SVD5 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vmn1r196Q5SVD5 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vmn1r196Q5SVD5 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vmn1r196Q5SVD5 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Vmn1r196Q5SVD5 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vmn1r196Q5SVD5 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vmn1r196Q5SVD5 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vmn1r196Q5SVD5 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vmn1r196Q5SVD5 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vmn1r196Q5SVD5 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vmn1r196Q5SVD5 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vmn1r196Q5SVD5 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vmn1r196Q5SVD5 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Vmn1r196Q5SVD5 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vmn1r196Q5SVD5 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vmn1r196Q5SVD5 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vmn1r196Q5SVD5 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vmn1r196Q5SVD5 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vmn1r196Q5SVD5 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vmn1r196Q5SVD5 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vmn1r196Q5SVD5 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vmn1r196Q5SVD5 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vmn1r196Q5SVD5 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vmn1r196Q5SVD5 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vmn1r196Q5SVD5 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vmn1r196Q5SVD5 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vmn1r196Q5SVD5 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Vmn1r196Q5SVD5 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vmn1r196Q5SVD5 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vmn1r196Q5SVD5 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vmn1r196Q5SVD5 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vmn1r196Q5SVD5 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vmn1r196Q5SVD5 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vmn1r196Q5SVD5 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vmn1r196Q5SVD5 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vmn1r196Q5SVD5 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vmn1r196Q5SVD5 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vmn1r196Q5SVD5 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vmn1r196Q5SVD5 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vmn1r196Q5SVD5 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vmn1r196Q5SVD5 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vmn1r196Q5SVD5 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vmn1r196Q5SVD5 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vmn1r196Q5SVD5 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vmn1r196Q5SVD5 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vmn1r196Q5SVD5 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Vmn1r196Q5SVD5 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Vmn1r196Q5SVD5 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Vmn1r196Q5SVD5 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Vmn1r196Q5SVD5 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Vmn1r196Q5SVD5 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vmn1r196Q5SVD5 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vmn1r196Q5SVD5 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vmn1r196Q5SVD5 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vmn1r196Q5SVD5 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vmn1r196Q5SVD5 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vmn1r196Q5SVD5 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vmn1r196Q5SVD5 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vmn1r196Q5SVD5 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vmn1r196Q5SVD5 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vmn1r196Q5SVD5 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vmn1r196Q5SVD5 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vmn1r196Q5SVD5 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vmn1r196Q5SVD5 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vmn1r196Q5SVD5 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vmn1r196Q5SVD5 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vmn1r196Q5SVD5 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vmn1r196Q5SVD5 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vmn1r196Q5SVD5 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vmn1r196Q5SVD5 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vmn1r196Q5SVD5 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vmn1r196Q5SVD5 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vmn1r196Q5SVD5 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vmn1r196Q5SVD5 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vmn1r196Q5SVD5 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vmn1r196Q5SVD5 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Vmn1r196Q5SVD5 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vmn1r196Q5SVD5 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vmn1r196Q5SVD5 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vmn1r196Q5SVD5 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vmn1r196Q5SVD5 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vmn1r196Q5SVD5 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vmn1r196Q5SVD5 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vmn1r196Q5SVD5 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vmn1r196Q5SVD5 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.4 ms