Protein–RNA interactions for Protein: Q5SUE8

Ankrd40, Ankyrin repeat domain-containing protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd40Q5SUE8 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ankrd40Q5SUE8 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ankrd40Q5SUE8 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ankrd40Q5SUE8 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ankrd40Q5SUE8 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ankrd40Q5SUE8 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ankrd40Q5SUE8 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ankrd40Q5SUE8 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ankrd40Q5SUE8 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ankrd40Q5SUE8 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ankrd40Q5SUE8 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ankrd40Q5SUE8 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Ankrd40Q5SUE8 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ankrd40Q5SUE8 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Ankrd40Q5SUE8 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ankrd40Q5SUE8 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ankrd40Q5SUE8 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Ankrd40Q5SUE8 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ankrd40Q5SUE8 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ankrd40Q5SUE8 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ankrd40Q5SUE8 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ankrd40Q5SUE8 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Ankrd40Q5SUE8 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ankrd40Q5SUE8 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ankrd40Q5SUE8 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ankrd40Q5SUE8 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ankrd40Q5SUE8 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Ankrd40Q5SUE8 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ankrd40Q5SUE8 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ankrd40Q5SUE8 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ankrd40Q5SUE8 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ankrd40Q5SUE8 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ankrd40Q5SUE8 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Ankrd40Q5SUE8 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ankrd40Q5SUE8 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ankrd40Q5SUE8 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ankrd40Q5SUE8 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ankrd40Q5SUE8 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ankrd40Q5SUE8 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ankrd40Q5SUE8 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ankrd40Q5SUE8 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ankrd40Q5SUE8 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ankrd40Q5SUE8 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ankrd40Q5SUE8 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ankrd40Q5SUE8 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ankrd40Q5SUE8 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ankrd40Q5SUE8 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ankrd40Q5SUE8 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ankrd40Q5SUE8 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ankrd40Q5SUE8 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ankrd40Q5SUE8 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ankrd40Q5SUE8 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ankrd40Q5SUE8 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ankrd40Q5SUE8 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ankrd40Q5SUE8 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ankrd40Q5SUE8 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ankrd40Q5SUE8 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ankrd40Q5SUE8 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ankrd40Q5SUE8 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ankrd40Q5SUE8 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ankrd40Q5SUE8 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ankrd40Q5SUE8 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ankrd40Q5SUE8 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ankrd40Q5SUE8 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ankrd40Q5SUE8 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ankrd40Q5SUE8 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ankrd40Q5SUE8 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ankrd40Q5SUE8 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ankrd40Q5SUE8 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ankrd40Q5SUE8 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Ankrd40Q5SUE8 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ankrd40Q5SUE8 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ankrd40Q5SUE8 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ankrd40Q5SUE8 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ankrd40Q5SUE8 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ankrd40Q5SUE8 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ankrd40Q5SUE8 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Ankrd40Q5SUE8 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ankrd40Q5SUE8 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Ankrd40Q5SUE8 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Ankrd40Q5SUE8 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ankrd40Q5SUE8 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ankrd40Q5SUE8 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Ankrd40Q5SUE8 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ankrd40Q5SUE8 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ankrd40Q5SUE8 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Ankrd40Q5SUE8 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Ankrd40Q5SUE8 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ankrd40Q5SUE8 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ankrd40Q5SUE8 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Ankrd40Q5SUE8 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Ankrd40Q5SUE8 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ankrd40Q5SUE8 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ankrd40Q5SUE8 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ankrd40Q5SUE8 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ankrd40Q5SUE8 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ankrd40Q5SUE8 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ankrd40Q5SUE8 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ankrd40Q5SUE8 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Ankrd40Q5SUE8 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms