Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sft2d1Q5SSN7 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sft2d1Q5SSN7 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sft2d1Q5SSN7 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sft2d1Q5SSN7 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sft2d1Q5SSN7 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sft2d1Q5SSN7 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sft2d1Q5SSN7 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sft2d1Q5SSN7 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sft2d1Q5SSN7 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sft2d1Q5SSN7 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sft2d1Q5SSN7 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sft2d1Q5SSN7 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sft2d1Q5SSN7 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sft2d1Q5SSN7 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sft2d1Q5SSN7 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sft2d1Q5SSN7 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sft2d1Q5SSN7 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sft2d1Q5SSN7 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sft2d1Q5SSN7 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sft2d1Q5SSN7 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sft2d1Q5SSN7 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sft2d1Q5SSN7 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sft2d1Q5SSN7 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sft2d1Q5SSN7 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sft2d1Q5SSN7 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sft2d1Q5SSN7 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sft2d1Q5SSN7 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sft2d1Q5SSN7 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sft2d1Q5SSN7 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sft2d1Q5SSN7 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sft2d1Q5SSN7 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sft2d1Q5SSN7 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sft2d1Q5SSN7 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sft2d1Q5SSN7 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sft2d1Q5SSN7 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sft2d1Q5SSN7 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sft2d1Q5SSN7 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sft2d1Q5SSN7 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sft2d1Q5SSN7 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sft2d1Q5SSN7 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Sft2d1Q5SSN7 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sft2d1Q5SSN7 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sft2d1Q5SSN7 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sft2d1Q5SSN7 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sft2d1Q5SSN7 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sft2d1Q5SSN7 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sft2d1Q5SSN7 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sft2d1Q5SSN7 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sft2d1Q5SSN7 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sft2d1Q5SSN7 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sft2d1Q5SSN7 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sft2d1Q5SSN7 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sft2d1Q5SSN7 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sft2d1Q5SSN7 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sft2d1Q5SSN7 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sft2d1Q5SSN7 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.02
Sft2d1Q5SSN7 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sft2d1Q5SSN7 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sft2d1Q5SSN7 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sft2d1Q5SSN7 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sft2d1Q5SSN7 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sft2d1Q5SSN7 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sft2d1Q5SSN7 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Sft2d1Q5SSN7 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Sft2d1Q5SSN7 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sft2d1Q5SSN7 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Sft2d1Q5SSN7 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sft2d1Q5SSN7 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sft2d1Q5SSN7 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sft2d1Q5SSN7 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sft2d1Q5SSN7 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Sft2d1Q5SSN7 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sft2d1Q5SSN7 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sft2d1Q5SSN7 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sft2d1Q5SSN7 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sft2d1Q5SSN7 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sft2d1Q5SSN7 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sft2d1Q5SSN7 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sft2d1Q5SSN7 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sft2d1Q5SSN7 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sft2d1Q5SSN7 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sft2d1Q5SSN7 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sft2d1Q5SSN7 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sft2d1Q5SSN7 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sft2d1Q5SSN7 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Sft2d1Q5SSN7 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sft2d1Q5SSN7 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sft2d1Q5SSN7 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sft2d1Q5SSN7 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sft2d1Q5SSN7 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sft2d1Q5SSN7 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sft2d1Q5SSN7 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sft2d1Q5SSN7 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sft2d1Q5SSN7 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sft2d1Q5SSN7 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sft2d1Q5SSN7 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sft2d1Q5SSN7 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sft2d1Q5SSN7 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sft2d1Q5SSN7 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms