Protein–RNA interactions for Protein: Q5SNZ0

Ccdc88a, Girdin, mousemouse

Predictions only

Length 1,873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88aQ5SNZ0 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc88aQ5SNZ0 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc88aQ5SNZ0 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc88aQ5SNZ0 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc88aQ5SNZ0 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc88aQ5SNZ0 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc88aQ5SNZ0 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc88aQ5SNZ0 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc88aQ5SNZ0 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc88aQ5SNZ0 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc88aQ5SNZ0 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc88aQ5SNZ0 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc88aQ5SNZ0 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc88aQ5SNZ0 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc88aQ5SNZ0 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc88aQ5SNZ0 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Ccdc88aQ5SNZ0 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Ccdc88aQ5SNZ0 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc88aQ5SNZ0 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc88aQ5SNZ0 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc88aQ5SNZ0 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc88aQ5SNZ0 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc88aQ5SNZ0 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc88aQ5SNZ0 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc88aQ5SNZ0 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc88aQ5SNZ0 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc88aQ5SNZ0 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc88aQ5SNZ0 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc88aQ5SNZ0 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc88aQ5SNZ0 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc88aQ5SNZ0 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc88aQ5SNZ0 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc88aQ5SNZ0 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc88aQ5SNZ0 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc88aQ5SNZ0 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc88aQ5SNZ0 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc88aQ5SNZ0 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc88aQ5SNZ0 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc88aQ5SNZ0 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc88aQ5SNZ0 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc88aQ5SNZ0 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc88aQ5SNZ0 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc88aQ5SNZ0 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc88aQ5SNZ0 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc88aQ5SNZ0 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc88aQ5SNZ0 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc88aQ5SNZ0 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc88aQ5SNZ0 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc88aQ5SNZ0 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc88aQ5SNZ0 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc88aQ5SNZ0 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc88aQ5SNZ0 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc88aQ5SNZ0 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc88aQ5SNZ0 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc88aQ5SNZ0 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc88aQ5SNZ0 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc88aQ5SNZ0 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc88aQ5SNZ0 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc88aQ5SNZ0 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc88aQ5SNZ0 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc88aQ5SNZ0 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc88aQ5SNZ0 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc88aQ5SNZ0 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc88aQ5SNZ0 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc88aQ5SNZ0 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc88aQ5SNZ0 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc88aQ5SNZ0 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc88aQ5SNZ0 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc88aQ5SNZ0 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc88aQ5SNZ0 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc88aQ5SNZ0 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc88aQ5SNZ0 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc88aQ5SNZ0 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc88aQ5SNZ0 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc88aQ5SNZ0 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc88aQ5SNZ0 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc88aQ5SNZ0 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc88aQ5SNZ0 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc88aQ5SNZ0 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc88aQ5SNZ0 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc88aQ5SNZ0 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc88aQ5SNZ0 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc88aQ5SNZ0 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
Ccdc88aQ5SNZ0 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc88aQ5SNZ0 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc88aQ5SNZ0 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc88aQ5SNZ0 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc88aQ5SNZ0 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc88aQ5SNZ0 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc88aQ5SNZ0 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms