Protein–RNA interactions for Protein: Q5RJB0

Bhlha9, Class A basic helix-loop-helix protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlha9Q5RJB0 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Bhlha9Q5RJB0 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Bhlha9Q5RJB0 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Bhlha9Q5RJB0 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Bhlha9Q5RJB0 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Bhlha9Q5RJB0 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Bhlha9Q5RJB0 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Bhlha9Q5RJB0 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Bhlha9Q5RJB0 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Bhlha9Q5RJB0 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Bhlha9Q5RJB0 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Bhlha9Q5RJB0 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Bhlha9Q5RJB0 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Bhlha9Q5RJB0 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Bhlha9Q5RJB0 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Bhlha9Q5RJB0 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Bhlha9Q5RJB0 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Bhlha9Q5RJB0 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Bhlha9Q5RJB0 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Bhlha9Q5RJB0 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Bhlha9Q5RJB0 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Bhlha9Q5RJB0 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Bhlha9Q5RJB0 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Bhlha9Q5RJB0 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Bhlha9Q5RJB0 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Bhlha9Q5RJB0 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Bhlha9Q5RJB0 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Bhlha9Q5RJB0 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Bhlha9Q5RJB0 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Bhlha9Q5RJB0 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Bhlha9Q5RJB0 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Bhlha9Q5RJB0 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Bhlha9Q5RJB0 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Bhlha9Q5RJB0 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Bhlha9Q5RJB0 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Bhlha9Q5RJB0 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Bhlha9Q5RJB0 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Bhlha9Q5RJB0 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Bhlha9Q5RJB0 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Bhlha9Q5RJB0 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Bhlha9Q5RJB0 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Bhlha9Q5RJB0 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Bhlha9Q5RJB0 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Bhlha9Q5RJB0 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Bhlha9Q5RJB0 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Bhlha9Q5RJB0 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Bhlha9Q5RJB0 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Bhlha9Q5RJB0 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Bhlha9Q5RJB0 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Bhlha9Q5RJB0 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Bhlha9Q5RJB0 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Bhlha9Q5RJB0 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Bhlha9Q5RJB0 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Bhlha9Q5RJB0 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Bhlha9Q5RJB0 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Bhlha9Q5RJB0 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Bhlha9Q5RJB0 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Bhlha9Q5RJB0 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Bhlha9Q5RJB0 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Bhlha9Q5RJB0 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Bhlha9Q5RJB0 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Bhlha9Q5RJB0 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Bhlha9Q5RJB0 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Bhlha9Q5RJB0 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Bhlha9Q5RJB0 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Bhlha9Q5RJB0 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Bhlha9Q5RJB0 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Bhlha9Q5RJB0 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Bhlha9Q5RJB0 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Bhlha9Q5RJB0 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Bhlha9Q5RJB0 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Bhlha9Q5RJB0 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Bhlha9Q5RJB0 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Bhlha9Q5RJB0 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Bhlha9Q5RJB0 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Bhlha9Q5RJB0 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Bhlha9Q5RJB0 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Bhlha9Q5RJB0 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Bhlha9Q5RJB0 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Bhlha9Q5RJB0 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Bhlha9Q5RJB0 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Bhlha9Q5RJB0 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Bhlha9Q5RJB0 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Bhlha9Q5RJB0 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Bhlha9Q5RJB0 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Bhlha9Q5RJB0 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Bhlha9Q5RJB0 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Bhlha9Q5RJB0 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Bhlha9Q5RJB0 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Bhlha9Q5RJB0 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Bhlha9Q5RJB0 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Bhlha9Q5RJB0 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Bhlha9Q5RJB0 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Bhlha9Q5RJB0 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Bhlha9Q5RJB0 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Bhlha9Q5RJB0 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Bhlha9Q5RJB0 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Bhlha9Q5RJB0 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Bhlha9Q5RJB0 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Bhlha9Q5RJB0 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms