Protein–RNA interactions for Protein: Q5R1F6

Trav5d-4, T cell receptor alpha variable 5D-4 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trav5d-4Q5R1F6 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trav5d-4Q5R1F6 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Trav5d-4Q5R1F6 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Trav5d-4Q5R1F6 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Trav5d-4Q5R1F6 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trav5d-4Q5R1F6 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trav5d-4Q5R1F6 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trav5d-4Q5R1F6 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trav5d-4Q5R1F6 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trav5d-4Q5R1F6 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trav5d-4Q5R1F6 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trav5d-4Q5R1F6 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trav5d-4Q5R1F6 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trav5d-4Q5R1F6 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Trav5d-4Q5R1F6 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trav5d-4Q5R1F6 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trav5d-4Q5R1F6 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trav5d-4Q5R1F6 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Trav5d-4Q5R1F6 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trav5d-4Q5R1F6 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trav5d-4Q5R1F6 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trav5d-4Q5R1F6 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trav5d-4Q5R1F6 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trav5d-4Q5R1F6 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trav5d-4Q5R1F6 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trav5d-4Q5R1F6 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trav5d-4Q5R1F6 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trav5d-4Q5R1F6 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trav5d-4Q5R1F6 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trav5d-4Q5R1F6 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trav5d-4Q5R1F6 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trav5d-4Q5R1F6 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trav5d-4Q5R1F6 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trav5d-4Q5R1F6 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trav5d-4Q5R1F6 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trav5d-4Q5R1F6 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trav5d-4Q5R1F6 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trav5d-4Q5R1F6 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trav5d-4Q5R1F6 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trav5d-4Q5R1F6 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trav5d-4Q5R1F6 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trav5d-4Q5R1F6 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trav5d-4Q5R1F6 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trav5d-4Q5R1F6 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trav5d-4Q5R1F6 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trav5d-4Q5R1F6 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Trav5d-4Q5R1F6 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trav5d-4Q5R1F6 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trav5d-4Q5R1F6 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trav5d-4Q5R1F6 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trav5d-4Q5R1F6 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trav5d-4Q5R1F6 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trav5d-4Q5R1F6 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trav5d-4Q5R1F6 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trav5d-4Q5R1F6 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Trav5d-4Q5R1F6 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trav5d-4Q5R1F6 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trav5d-4Q5R1F6 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trav5d-4Q5R1F6 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trav5d-4Q5R1F6 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trav5d-4Q5R1F6 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trav5d-4Q5R1F6 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trav5d-4Q5R1F6 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trav5d-4Q5R1F6 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trav5d-4Q5R1F6 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trav5d-4Q5R1F6 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trav5d-4Q5R1F6 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trav5d-4Q5R1F6 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trav5d-4Q5R1F6 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trav5d-4Q5R1F6 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trav5d-4Q5R1F6 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trav5d-4Q5R1F6 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trav5d-4Q5R1F6 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trav5d-4Q5R1F6 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trav5d-4Q5R1F6 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trav5d-4Q5R1F6 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Trav5d-4Q5R1F6 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Trav5d-4Q5R1F6 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Trav5d-4Q5R1F6 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trav5d-4Q5R1F6 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trav5d-4Q5R1F6 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trav5d-4Q5R1F6 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trav5d-4Q5R1F6 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trav5d-4Q5R1F6 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trav5d-4Q5R1F6 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trav5d-4Q5R1F6 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trav5d-4Q5R1F6 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trav5d-4Q5R1F6 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trav5d-4Q5R1F6 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trav5d-4Q5R1F6 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trav5d-4Q5R1F6 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Trav5d-4Q5R1F6 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trav5d-4Q5R1F6 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trav5d-4Q5R1F6 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trav5d-4Q5R1F6 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trav5d-4Q5R1F6 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trav5d-4Q5R1F6 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trav5d-4Q5R1F6 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trav5d-4Q5R1F6 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trav5d-4Q5R1F6 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.3 ms