Protein–RNA interactions for Protein: Q5GFD5

Hs3st6, Heparan sulfate glucosamine 3-O-sulfotransferase 6, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hs3st6Q5GFD5 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hs3st6Q5GFD5 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hs3st6Q5GFD5 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hs3st6Q5GFD5 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hs3st6Q5GFD5 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hs3st6Q5GFD5 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hs3st6Q5GFD5 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hs3st6Q5GFD5 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hs3st6Q5GFD5 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hs3st6Q5GFD5 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hs3st6Q5GFD5 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hs3st6Q5GFD5 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Hs3st6Q5GFD5 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Hs3st6Q5GFD5 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hs3st6Q5GFD5 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hs3st6Q5GFD5 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hs3st6Q5GFD5 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hs3st6Q5GFD5 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hs3st6Q5GFD5 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hs3st6Q5GFD5 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hs3st6Q5GFD5 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hs3st6Q5GFD5 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hs3st6Q5GFD5 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hs3st6Q5GFD5 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hs3st6Q5GFD5 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hs3st6Q5GFD5 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hs3st6Q5GFD5 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hs3st6Q5GFD5 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hs3st6Q5GFD5 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hs3st6Q5GFD5 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hs3st6Q5GFD5 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hs3st6Q5GFD5 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hs3st6Q5GFD5 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hs3st6Q5GFD5 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hs3st6Q5GFD5 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hs3st6Q5GFD5 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hs3st6Q5GFD5 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hs3st6Q5GFD5 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hs3st6Q5GFD5 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hs3st6Q5GFD5 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hs3st6Q5GFD5 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hs3st6Q5GFD5 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hs3st6Q5GFD5 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hs3st6Q5GFD5 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hs3st6Q5GFD5 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hs3st6Q5GFD5 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hs3st6Q5GFD5 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hs3st6Q5GFD5 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hs3st6Q5GFD5 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hs3st6Q5GFD5 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hs3st6Q5GFD5 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hs3st6Q5GFD5 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hs3st6Q5GFD5 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hs3st6Q5GFD5 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hs3st6Q5GFD5 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hs3st6Q5GFD5 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Hs3st6Q5GFD5 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hs3st6Q5GFD5 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Hs3st6Q5GFD5 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hs3st6Q5GFD5 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hs3st6Q5GFD5 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hs3st6Q5GFD5 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hs3st6Q5GFD5 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hs3st6Q5GFD5 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hs3st6Q5GFD5 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hs3st6Q5GFD5 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hs3st6Q5GFD5 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hs3st6Q5GFD5 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hs3st6Q5GFD5 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hs3st6Q5GFD5 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hs3st6Q5GFD5 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hs3st6Q5GFD5 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hs3st6Q5GFD5 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hs3st6Q5GFD5 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hs3st6Q5GFD5 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hs3st6Q5GFD5 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hs3st6Q5GFD5 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hs3st6Q5GFD5 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hs3st6Q5GFD5 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hs3st6Q5GFD5 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hs3st6Q5GFD5 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hs3st6Q5GFD5 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hs3st6Q5GFD5 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Hs3st6Q5GFD5 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Hs3st6Q5GFD5 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Hs3st6Q5GFD5 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hs3st6Q5GFD5 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hs3st6Q5GFD5 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hs3st6Q5GFD5 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hs3st6Q5GFD5 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hs3st6Q5GFD5 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hs3st6Q5GFD5 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hs3st6Q5GFD5 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hs3st6Q5GFD5 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hs3st6Q5GFD5 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hs3st6Q5GFD5 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hs3st6Q5GFD5 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hs3st6Q5GFD5 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hs3st6Q5GFD5 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hs3st6Q5GFD5 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms