Protein–RNA interactions for Protein: Q5F289

Spem1, Spermatid maturation protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spem1Q5F289 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Spem1Q5F289 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Spem1Q5F289 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Spem1Q5F289 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Spem1Q5F289 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Spem1Q5F289 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Spem1Q5F289 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Spem1Q5F289 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Spem1Q5F289 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Spem1Q5F289 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Spem1Q5F289 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Spem1Q5F289 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Spem1Q5F289 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Spem1Q5F289 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Spem1Q5F289 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Spem1Q5F289 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Spem1Q5F289 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Spem1Q5F289 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Spem1Q5F289 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Spem1Q5F289 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Spem1Q5F289 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Spem1Q5F289 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Spem1Q5F289 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Spem1Q5F289 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Spem1Q5F289 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Spem1Q5F289 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Spem1Q5F289 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Spem1Q5F289 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Spem1Q5F289 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Spem1Q5F289 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Spem1Q5F289 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Spem1Q5F289 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Spem1Q5F289 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Spem1Q5F289 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Spem1Q5F289 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Spem1Q5F289 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Spem1Q5F289 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Spem1Q5F289 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Spem1Q5F289 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Spem1Q5F289 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Spem1Q5F289 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Spem1Q5F289 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Spem1Q5F289 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Spem1Q5F289 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Spem1Q5F289 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Spem1Q5F289 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Spem1Q5F289 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Spem1Q5F289 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Spem1Q5F289 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Spem1Q5F289 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Spem1Q5F289 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Spem1Q5F289 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Spem1Q5F289 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Spem1Q5F289 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Spem1Q5F289 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Spem1Q5F289 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Spem1Q5F289 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Spem1Q5F289 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Spem1Q5F289 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Spem1Q5F289 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Spem1Q5F289 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Spem1Q5F289 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Spem1Q5F289 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Spem1Q5F289 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Spem1Q5F289 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Spem1Q5F289 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Spem1Q5F289 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Spem1Q5F289 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Spem1Q5F289 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Spem1Q5F289 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Spem1Q5F289 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Spem1Q5F289 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Spem1Q5F289 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Spem1Q5F289 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Spem1Q5F289 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Spem1Q5F289 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Spem1Q5F289 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Spem1Q5F289 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Spem1Q5F289 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Spem1Q5F289 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Spem1Q5F289 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Spem1Q5F289 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Spem1Q5F289 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Spem1Q5F289 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Spem1Q5F289 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Spem1Q5F289 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Spem1Q5F289 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Spem1Q5F289 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Spem1Q5F289 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Spem1Q5F289 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Spem1Q5F289 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Spem1Q5F289 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Spem1Q5F289 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Spem1Q5F289 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Spem1Q5F289 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Spem1Q5F289 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Spem1Q5F289 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Spem1Q5F289 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Spem1Q5F289 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Spem1Q5F289 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms