Protein–RNA interactions for Protein: Q3V118

Ccdc185, Coiled-coil domain-containing 185, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc185Q3V118 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc185Q3V118 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc185Q3V118 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc185Q3V118 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc185Q3V118 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc185Q3V118 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc185Q3V118 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc185Q3V118 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc185Q3V118 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc185Q3V118 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc185Q3V118 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc185Q3V118 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc185Q3V118 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc185Q3V118 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc185Q3V118 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc185Q3V118 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc185Q3V118 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc185Q3V118 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc185Q3V118 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc185Q3V118 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc185Q3V118 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc185Q3V118 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc185Q3V118 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc185Q3V118 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc185Q3V118 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc185Q3V118 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc185Q3V118 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc185Q3V118 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc185Q3V118 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc185Q3V118 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc185Q3V118 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc185Q3V118 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc185Q3V118 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc185Q3V118 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc185Q3V118 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc185Q3V118 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc185Q3V118 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc185Q3V118 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc185Q3V118 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc185Q3V118 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc185Q3V118 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc185Q3V118 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc185Q3V118 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc185Q3V118 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc185Q3V118 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc185Q3V118 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc185Q3V118 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc185Q3V118 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc185Q3V118 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc185Q3V118 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc185Q3V118 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc185Q3V118 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc185Q3V118 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc185Q3V118 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc185Q3V118 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc185Q3V118 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc185Q3V118 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc185Q3V118 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc185Q3V118 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc185Q3V118 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc185Q3V118 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc185Q3V118 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc185Q3V118 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc185Q3V118 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc185Q3V118 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc185Q3V118 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc185Q3V118 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc185Q3V118 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc185Q3V118 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc185Q3V118 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc185Q3V118 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc185Q3V118 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc185Q3V118 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ccdc185Q3V118 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ccdc185Q3V118 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ccdc185Q3V118 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ccdc185Q3V118 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ccdc185Q3V118 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc185Q3V118 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc185Q3V118 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc185Q3V118 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc185Q3V118 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc185Q3V118 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc185Q3V118 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc185Q3V118 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc185Q3V118 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc185Q3V118 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc185Q3V118 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc185Q3V118 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc185Q3V118 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc185Q3V118 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc185Q3V118 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc185Q3V118 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc185Q3V118 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc185Q3V118 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc185Q3V118 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc185Q3V118 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc185Q3V118 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc185Q3V118 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc185Q3V118 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms