Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0C5

Usp48, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 48, mousemouse

Predictions only

Length 1,052 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp48Q3V0C5 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Usp48Q3V0C5 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Usp48Q3V0C5 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Usp48Q3V0C5 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Usp48Q3V0C5 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Usp48Q3V0C5 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Usp48Q3V0C5 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Usp48Q3V0C5 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Usp48Q3V0C5 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Usp48Q3V0C5 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Usp48Q3V0C5 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Usp48Q3V0C5 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Usp48Q3V0C5 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Usp48Q3V0C5 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Usp48Q3V0C5 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Usp48Q3V0C5 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Usp48Q3V0C5 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Usp48Q3V0C5 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Usp48Q3V0C5 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Usp48Q3V0C5 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Usp48Q3V0C5 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Usp48Q3V0C5 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Usp48Q3V0C5 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Usp48Q3V0C5 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Usp48Q3V0C5 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Usp48Q3V0C5 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Usp48Q3V0C5 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Usp48Q3V0C5 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Usp48Q3V0C5 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Usp48Q3V0C5 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Usp48Q3V0C5 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Usp48Q3V0C5 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Usp48Q3V0C5 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Usp48Q3V0C5 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Usp48Q3V0C5 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Usp48Q3V0C5 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Usp48Q3V0C5 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Usp48Q3V0C5 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Usp48Q3V0C5 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Usp48Q3V0C5 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Usp48Q3V0C5 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Usp48Q3V0C5 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Usp48Q3V0C5 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Usp48Q3V0C5 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Usp48Q3V0C5 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Usp48Q3V0C5 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Usp48Q3V0C5 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Usp48Q3V0C5 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Usp48Q3V0C5 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Usp48Q3V0C5 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Usp48Q3V0C5 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Usp48Q3V0C5 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Usp48Q3V0C5 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Usp48Q3V0C5 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Usp48Q3V0C5 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Usp48Q3V0C5 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Usp48Q3V0C5 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Usp48Q3V0C5 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Usp48Q3V0C5 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Usp48Q3V0C5 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Usp48Q3V0C5 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Usp48Q3V0C5 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Usp48Q3V0C5 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Usp48Q3V0C5 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Usp48Q3V0C5 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Usp48Q3V0C5 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Usp48Q3V0C5 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Usp48Q3V0C5 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Usp48Q3V0C5 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Usp48Q3V0C5 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Usp48Q3V0C5 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Usp48Q3V0C5 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Usp48Q3V0C5 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Usp48Q3V0C5 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Usp48Q3V0C5 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Usp48Q3V0C5 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Usp48Q3V0C5 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Usp48Q3V0C5 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Usp48Q3V0C5 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Usp48Q3V0C5 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Usp48Q3V0C5 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Usp48Q3V0C5 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Usp48Q3V0C5 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Usp48Q3V0C5 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Usp48Q3V0C5 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Usp48Q3V0C5 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Usp48Q3V0C5 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Usp48Q3V0C5 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Usp48Q3V0C5 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Usp48Q3V0C5 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Usp48Q3V0C5 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Usp48Q3V0C5 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Usp48Q3V0C5 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Usp48Q3V0C5 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Usp48Q3V0C5 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Usp48Q3V0C5 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Usp48Q3V0C5 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Usp48Q3V0C5 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Usp48Q3V0C5 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Usp48Q3V0C5 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
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