Protein–RNA interactions for Protein: Q3UU67

Trat1, T-cell receptor-associated transmembrane adapter 1, mousemouse

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trat1Q3UU67 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trat1Q3UU67 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trat1Q3UU67 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trat1Q3UU67 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trat1Q3UU67 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trat1Q3UU67 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trat1Q3UU67 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trat1Q3UU67 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trat1Q3UU67 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trat1Q3UU67 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trat1Q3UU67 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trat1Q3UU67 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trat1Q3UU67 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trat1Q3UU67 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Trat1Q3UU67 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trat1Q3UU67 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trat1Q3UU67 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trat1Q3UU67 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trat1Q3UU67 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trat1Q3UU67 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trat1Q3UU67 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trat1Q3UU67 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trat1Q3UU67 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trat1Q3UU67 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trat1Q3UU67 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trat1Q3UU67 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trat1Q3UU67 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trat1Q3UU67 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trat1Q3UU67 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trat1Q3UU67 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trat1Q3UU67 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Trat1Q3UU67 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trat1Q3UU67 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Trat1Q3UU67 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Trat1Q3UU67 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trat1Q3UU67 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trat1Q3UU67 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trat1Q3UU67 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trat1Q3UU67 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trat1Q3UU67 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trat1Q3UU67 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trat1Q3UU67 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trat1Q3UU67 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trat1Q3UU67 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trat1Q3UU67 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trat1Q3UU67 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trat1Q3UU67 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trat1Q3UU67 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trat1Q3UU67 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trat1Q3UU67 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trat1Q3UU67 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trat1Q3UU67 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trat1Q3UU67 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trat1Q3UU67 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trat1Q3UU67 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trat1Q3UU67 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trat1Q3UU67 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trat1Q3UU67 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trat1Q3UU67 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trat1Q3UU67 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trat1Q3UU67 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trat1Q3UU67 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trat1Q3UU67 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trat1Q3UU67 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trat1Q3UU67 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trat1Q3UU67 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trat1Q3UU67 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trat1Q3UU67 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trat1Q3UU67 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trat1Q3UU67 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trat1Q3UU67 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trat1Q3UU67 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trat1Q3UU67 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trat1Q3UU67 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trat1Q3UU67 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trat1Q3UU67 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trat1Q3UU67 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trat1Q3UU67 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Trat1Q3UU67 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Trat1Q3UU67 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trat1Q3UU67 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Trat1Q3UU67 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Trat1Q3UU67 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trat1Q3UU67 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Trat1Q3UU67 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Trat1Q3UU67 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trat1Q3UU67 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trat1Q3UU67 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trat1Q3UU67 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trat1Q3UU67 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trat1Q3UU67 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trat1Q3UU67 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trat1Q3UU67 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trat1Q3UU67 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Trat1Q3UU67 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Trat1Q3UU67 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trat1Q3UU67 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trat1Q3UU67 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trat1Q3UU67 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Trat1Q3UU67 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms